Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IRF5Q13568 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IRF5Q13568 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IRF5Q13568 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IRF5Q13568 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IRF5Q13568 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IRF5Q13568 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IRF5Q13568 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IRF5Q13568 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IRF5Q13568 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IRF5Q13568 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IRF5Q13568 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IRF5Q13568 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IRF5Q13568 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IRF5Q13568 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IRF5Q13568 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IRF5Q13568 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
IRF5Q13568 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IRF5Q13568 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IRF5Q13568 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IRF5Q13568 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IRF5Q13568 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IRF5Q13568 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IRF5Q13568 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IRF5Q13568 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IRF5Q13568 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
IRF5Q13568 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IRF5Q13568 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IRF5Q13568 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IRF5Q13568 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IRF5Q13568 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
IRF5Q13568 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IRF5Q13568 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IRF5Q13568 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IRF5Q13568 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IRF5Q13568 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IRF5Q13568 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
IRF5Q13568 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
IRF5Q13568 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IRF5Q13568 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IRF5Q13568 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
IRF5Q13568 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IRF5Q13568 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
IRF5Q13568 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
IRF5Q13568 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
IRF5Q13568 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IRF5Q13568 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IRF5Q13568 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IRF5Q13568 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
IRF5Q13568 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IRF5Q13568 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IRF5Q13568 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
IRF5Q13568 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IRF5Q13568 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
IRF5Q13568 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
IRF5Q13568 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
IRF5Q13568 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
IRF5Q13568 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IRF5Q13568 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
IRF5Q13568 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IRF5Q13568 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IRF5Q13568 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IRF5Q13568 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IRF5Q13568 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
IRF5Q13568 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
IRF5Q13568 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
IRF5Q13568 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IRF5Q13568 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IRF5Q13568 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
IRF5Q13568 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IRF5Q13568 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IRF5Q13568 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IRF5Q13568 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IRF5Q13568 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IRF5Q13568 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
IRF5Q13568 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
IRF5Q13568 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IRF5Q13568 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
IRF5Q13568 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
IRF5Q13568 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
IRF5Q13568 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
IRF5Q13568 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
IRF5Q13568 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
IRF5Q13568 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
IRF5Q13568 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
IRF5Q13568 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
IRF5Q13568 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IRF5Q13568 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IRF5Q13568 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
IRF5Q13568 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IRF5Q13568 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
IRF5Q13568 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IRF5Q13568 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
IRF5Q13568 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
IRF5Q13568 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
IRF5Q13568 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
IRF5Q13568 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
IRF5Q13568 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
IRF5Q13568 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
IRF5Q13568 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms