Protein–RNA interactions for Protein: Q13491

GPM6B, Neuronal membrane glycoprotein M6-b, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPM6BQ13491 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GPM6BQ13491 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GPM6BQ13491 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GPM6BQ13491 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GPM6BQ13491 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GPM6BQ13491 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GPM6BQ13491 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GPM6BQ13491 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GPM6BQ13491 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GPM6BQ13491 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GPM6BQ13491 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GPM6BQ13491 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GPM6BQ13491 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
GPM6BQ13491 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GPM6BQ13491 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
GPM6BQ13491 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GPM6BQ13491 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GPM6BQ13491 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
GPM6BQ13491 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GPM6BQ13491 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GPM6BQ13491 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GPM6BQ13491 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GPM6BQ13491 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GPM6BQ13491 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GPM6BQ13491 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GPM6BQ13491 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GPM6BQ13491 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GPM6BQ13491 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GPM6BQ13491 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GPM6BQ13491 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GPM6BQ13491 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
GPM6BQ13491 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GPM6BQ13491 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GPM6BQ13491 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GPM6BQ13491 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GPM6BQ13491 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GPM6BQ13491 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
GPM6BQ13491 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GPM6BQ13491 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GPM6BQ13491 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GPM6BQ13491 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GPM6BQ13491 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GPM6BQ13491 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GPM6BQ13491 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GPM6BQ13491 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GPM6BQ13491 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GPM6BQ13491 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GPM6BQ13491 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
GPM6BQ13491 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GPM6BQ13491 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GPM6BQ13491 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GPM6BQ13491 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GPM6BQ13491 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GPM6BQ13491 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GPM6BQ13491 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GPM6BQ13491 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
GPM6BQ13491 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GPM6BQ13491 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GPM6BQ13491 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GPM6BQ13491 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GPM6BQ13491 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
GPM6BQ13491 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
GPM6BQ13491 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GPM6BQ13491 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GPM6BQ13491 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GPM6BQ13491 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GPM6BQ13491 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GPM6BQ13491 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GPM6BQ13491 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GPM6BQ13491 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GPM6BQ13491 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GPM6BQ13491 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GPM6BQ13491 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GPM6BQ13491 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GPM6BQ13491 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GPM6BQ13491 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GPM6BQ13491 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GPM6BQ13491 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GPM6BQ13491 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GPM6BQ13491 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GPM6BQ13491 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GPM6BQ13491 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GPM6BQ13491 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GPM6BQ13491 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GPM6BQ13491 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GPM6BQ13491 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GPM6BQ13491 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GPM6BQ13491 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GPM6BQ13491 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GPM6BQ13491 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GPM6BQ13491 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GPM6BQ13491 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GPM6BQ13491 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GPM6BQ13491 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
GPM6BQ13491 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GPM6BQ13491 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
GPM6BQ13491 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
GPM6BQ13491 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GPM6BQ13491 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GPM6BQ13491 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
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