Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FOXD4Q12950 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FOXD4Q12950 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FOXD4Q12950 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FOXD4Q12950 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FOXD4Q12950 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FOXD4Q12950 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FOXD4Q12950 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FOXD4Q12950 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
FOXD4Q12950 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
FOXD4Q12950 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
FOXD4Q12950 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
FOXD4Q12950 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FOXD4Q12950 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FOXD4Q12950 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
FOXD4Q12950 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FOXD4Q12950 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
FOXD4Q12950 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
FOXD4Q12950 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FOXD4Q12950 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FOXD4Q12950 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
FOXD4Q12950 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FOXD4Q12950 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FOXD4Q12950 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FOXD4Q12950 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FOXD4Q12950 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXD4Q12950 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXD4Q12950 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXD4Q12950 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXD4Q12950 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXD4Q12950 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXD4Q12950 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXD4Q12950 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXD4Q12950 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXD4Q12950 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXD4Q12950 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXD4Q12950 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXD4Q12950 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXD4Q12950 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXD4Q12950 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXD4Q12950 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXD4Q12950 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXD4Q12950 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXD4Q12950 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXD4Q12950 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXD4Q12950 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXD4Q12950 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXD4Q12950 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXD4Q12950 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXD4Q12950 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXD4Q12950 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXD4Q12950 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
FOXD4Q12950 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
FOXD4Q12950 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
FOXD4Q12950 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
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