Protein–RNA interactions for Protein: Q12809

KCNH2, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH2Q12809 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KCNH2Q12809 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KCNH2Q12809 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KCNH2Q12809 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KCNH2Q12809 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KCNH2Q12809 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KCNH2Q12809 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
KCNH2Q12809 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KCNH2Q12809 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KCNH2Q12809 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KCNH2Q12809 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KCNH2Q12809 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KCNH2Q12809 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KCNH2Q12809 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
KCNH2Q12809 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
KCNH2Q12809 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
KCNH2Q12809 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KCNH2Q12809 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KCNH2Q12809 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KCNH2Q12809 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
KCNH2Q12809 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KCNH2Q12809 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KCNH2Q12809 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KCNH2Q12809 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
KCNH2Q12809 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KCNH2Q12809 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KCNH2Q12809 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KCNH2Q12809 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KCNH2Q12809 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KCNH2Q12809 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KCNH2Q12809 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KCNH2Q12809 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KCNH2Q12809 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNH2Q12809 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNH2Q12809 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNH2Q12809 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNH2Q12809 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNH2Q12809 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNH2Q12809 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNH2Q12809 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNH2Q12809 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNH2Q12809 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNH2Q12809 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNH2Q12809 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNH2Q12809 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNH2Q12809 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNH2Q12809 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNH2Q12809 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNH2Q12809 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNH2Q12809 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNH2Q12809 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNH2Q12809 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNH2Q12809 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNH2Q12809 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNH2Q12809 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNH2Q12809 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNH2Q12809 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNH2Q12809 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNH2Q12809 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNH2Q12809 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNH2Q12809 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNH2Q12809 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNH2Q12809 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNH2Q12809 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNH2Q12809 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNH2Q12809 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNH2Q12809 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNH2Q12809 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNH2Q12809 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNH2Q12809 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNH2Q12809 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNH2Q12809 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNH2Q12809 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNH2Q12809 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNH2Q12809 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNH2Q12809 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNH2Q12809 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNH2Q12809 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNH2Q12809 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNH2Q12809 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNH2Q12809 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNH2Q12809 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNH2Q12809 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNH2Q12809 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNH2Q12809 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNH2Q12809 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNH2Q12809 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNH2Q12809 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNH2Q12809 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNH2Q12809 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNH2Q12809 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNH2Q12809 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNH2Q12809 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNH2Q12809 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNH2Q12809 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNH2Q12809 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNH2Q12809 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNH2Q12809 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNH2Q12809 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNH2Q12809 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
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