Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCAPQ12770 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCAPQ12770 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCAPQ12770 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCAPQ12770 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCAPQ12770 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCAPQ12770 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCAPQ12770 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCAPQ12770 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCAPQ12770 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCAPQ12770 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SCAPQ12770 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCAPQ12770 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCAPQ12770 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCAPQ12770 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCAPQ12770 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCAPQ12770 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCAPQ12770 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCAPQ12770 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCAPQ12770 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCAPQ12770 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCAPQ12770 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCAPQ12770 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCAPQ12770 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SCAPQ12770 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCAPQ12770 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCAPQ12770 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCAPQ12770 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCAPQ12770 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCAPQ12770 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCAPQ12770 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCAPQ12770 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCAPQ12770 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCAPQ12770 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCAPQ12770 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCAPQ12770 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCAPQ12770 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCAPQ12770 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCAPQ12770 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCAPQ12770 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCAPQ12770 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCAPQ12770 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCAPQ12770 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCAPQ12770 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCAPQ12770 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCAPQ12770 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCAPQ12770 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCAPQ12770 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCAPQ12770 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCAPQ12770 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCAPQ12770 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCAPQ12770 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCAPQ12770 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCAPQ12770 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCAPQ12770 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCAPQ12770 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCAPQ12770 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCAPQ12770 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCAPQ12770 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCAPQ12770 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCAPQ12770 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCAPQ12770 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SCAPQ12770 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCAPQ12770 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCAPQ12770 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCAPQ12770 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCAPQ12770 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCAPQ12770 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCAPQ12770 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCAPQ12770 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCAPQ12770 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCAPQ12770 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCAPQ12770 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCAPQ12770 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCAPQ12770 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCAPQ12770 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCAPQ12770 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SCAPQ12770 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCAPQ12770 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCAPQ12770 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCAPQ12770 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCAPQ12770 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCAPQ12770 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCAPQ12770 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCAPQ12770 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCAPQ12770 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCAPQ12770 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCAPQ12770 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCAPQ12770 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCAPQ12770 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SCAPQ12770 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SCAPQ12770 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SCAPQ12770 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCAPQ12770 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCAPQ12770 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCAPQ12770 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCAPQ12770 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCAPQ12770 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCAPQ12770 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCAPQ12770 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
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