Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CGNL1Q0VF96 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CGNL1Q0VF96 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CGNL1Q0VF96 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CGNL1Q0VF96 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CGNL1Q0VF96 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CGNL1Q0VF96 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CGNL1Q0VF96 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CGNL1Q0VF96 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CGNL1Q0VF96 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CGNL1Q0VF96 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CGNL1Q0VF96 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CGNL1Q0VF96 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CGNL1Q0VF96 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CGNL1Q0VF96 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CGNL1Q0VF96 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CGNL1Q0VF96 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CGNL1Q0VF96 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CGNL1Q0VF96 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CGNL1Q0VF96 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CGNL1Q0VF96 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CGNL1Q0VF96 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CGNL1Q0VF96 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CGNL1Q0VF96 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CGNL1Q0VF96 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
CGNL1Q0VF96 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CGNL1Q0VF96 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CGNL1Q0VF96 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CGNL1Q0VF96 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
CGNL1Q0VF96 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CGNL1Q0VF96 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CGNL1Q0VF96 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CGNL1Q0VF96 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CGNL1Q0VF96 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CGNL1Q0VF96 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CGNL1Q0VF96 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CGNL1Q0VF96 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CGNL1Q0VF96 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CGNL1Q0VF96 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CGNL1Q0VF96 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CGNL1Q0VF96 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CGNL1Q0VF96 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CGNL1Q0VF96 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CGNL1Q0VF96 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CGNL1Q0VF96 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CGNL1Q0VF96 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CGNL1Q0VF96 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CGNL1Q0VF96 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CGNL1Q0VF96 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CGNL1Q0VF96 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CGNL1Q0VF96 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CGNL1Q0VF96 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CGNL1Q0VF96 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CGNL1Q0VF96 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CGNL1Q0VF96 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CGNL1Q0VF96 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CGNL1Q0VF96 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CGNL1Q0VF96 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CGNL1Q0VF96 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CGNL1Q0VF96 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CGNL1Q0VF96 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CGNL1Q0VF96 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CGNL1Q0VF96 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CGNL1Q0VF96 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CGNL1Q0VF96 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CGNL1Q0VF96 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CGNL1Q0VF96 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CGNL1Q0VF96 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CGNL1Q0VF96 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CGNL1Q0VF96 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CGNL1Q0VF96 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CGNL1Q0VF96 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CGNL1Q0VF96 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CGNL1Q0VF96 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CGNL1Q0VF96 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CGNL1Q0VF96 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CGNL1Q0VF96 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CGNL1Q0VF96 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CGNL1Q0VF96 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CGNL1Q0VF96 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CGNL1Q0VF96 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CGNL1Q0VF96 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CGNL1Q0VF96 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CGNL1Q0VF96 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CGNL1Q0VF96 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CGNL1Q0VF96 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CGNL1Q0VF96 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CGNL1Q0VF96 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CGNL1Q0VF96 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CGNL1Q0VF96 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CGNL1Q0VF96 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CGNL1Q0VF96 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CGNL1Q0VF96 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CGNL1Q0VF96 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CGNL1Q0VF96 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CGNL1Q0VF96 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CGNL1Q0VF96 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CGNL1Q0VF96 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CGNL1Q0VF96 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CGNL1Q0VF96 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms