Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAK6

LMOD3, Leiomodin-3, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD3Q0VAK6 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LMOD3Q0VAK6 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LMOD3Q0VAK6 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LMOD3Q0VAK6 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LMOD3Q0VAK6 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LMOD3Q0VAK6 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LMOD3Q0VAK6 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LMOD3Q0VAK6 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LMOD3Q0VAK6 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LMOD3Q0VAK6 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LMOD3Q0VAK6 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LMOD3Q0VAK6 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LMOD3Q0VAK6 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LMOD3Q0VAK6 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LMOD3Q0VAK6 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LMOD3Q0VAK6 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
LMOD3Q0VAK6 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
LMOD3Q0VAK6 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
LMOD3Q0VAK6 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LMOD3Q0VAK6 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LMOD3Q0VAK6 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LMOD3Q0VAK6 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LMOD3Q0VAK6 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
LMOD3Q0VAK6 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LMOD3Q0VAK6 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LMOD3Q0VAK6 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LMOD3Q0VAK6 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LMOD3Q0VAK6 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LMOD3Q0VAK6 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LMOD3Q0VAK6 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LMOD3Q0VAK6 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LMOD3Q0VAK6 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LMOD3Q0VAK6 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LMOD3Q0VAK6 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
LMOD3Q0VAK6 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
LMOD3Q0VAK6 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LMOD3Q0VAK6 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LMOD3Q0VAK6 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LMOD3Q0VAK6 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LMOD3Q0VAK6 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LMOD3Q0VAK6 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LMOD3Q0VAK6 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LMOD3Q0VAK6 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LMOD3Q0VAK6 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LMOD3Q0VAK6 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LMOD3Q0VAK6 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LMOD3Q0VAK6 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LMOD3Q0VAK6 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
LMOD3Q0VAK6 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LMOD3Q0VAK6 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LMOD3Q0VAK6 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LMOD3Q0VAK6 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LMOD3Q0VAK6 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LMOD3Q0VAK6 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMOD3Q0VAK6 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMOD3Q0VAK6 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMOD3Q0VAK6 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMOD3Q0VAK6 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
LMOD3Q0VAK6 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMOD3Q0VAK6 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMOD3Q0VAK6 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMOD3Q0VAK6 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMOD3Q0VAK6 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMOD3Q0VAK6 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMOD3Q0VAK6 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMOD3Q0VAK6 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMOD3Q0VAK6 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMOD3Q0VAK6 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
LMOD3Q0VAK6 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMOD3Q0VAK6 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMOD3Q0VAK6 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMOD3Q0VAK6 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMOD3Q0VAK6 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMOD3Q0VAK6 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMOD3Q0VAK6 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMOD3Q0VAK6 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMOD3Q0VAK6 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMOD3Q0VAK6 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMOD3Q0VAK6 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMOD3Q0VAK6 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMOD3Q0VAK6 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMOD3Q0VAK6 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
LMOD3Q0VAK6 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMOD3Q0VAK6 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
LMOD3Q0VAK6 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
LMOD3Q0VAK6 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMOD3Q0VAK6 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMOD3Q0VAK6 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMOD3Q0VAK6 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMOD3Q0VAK6 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMOD3Q0VAK6 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
LMOD3Q0VAK6 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMOD3Q0VAK6 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMOD3Q0VAK6 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMOD3Q0VAK6 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMOD3Q0VAK6 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMOD3Q0VAK6 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
LMOD3Q0VAK6 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LMOD3Q0VAK6 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LMOD3Q0VAK6 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms