Protein–RNA interactions for Protein: Q08722

CD47, Leukocyte surface antigen CD47, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD47Q08722 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD47Q08722 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CD47Q08722 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD47Q08722 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CD47Q08722 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD47Q08722 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD47Q08722 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD47Q08722 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD47Q08722 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD47Q08722 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD47Q08722 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD47Q08722 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD47Q08722 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD47Q08722 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD47Q08722 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD47Q08722 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD47Q08722 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD47Q08722 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD47Q08722 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD47Q08722 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD47Q08722 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD47Q08722 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CD47Q08722 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD47Q08722 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CD47Q08722 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD47Q08722 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD47Q08722 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD47Q08722 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD47Q08722 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD47Q08722 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD47Q08722 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD47Q08722 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD47Q08722 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD47Q08722 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD47Q08722 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CD47Q08722 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD47Q08722 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD47Q08722 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD47Q08722 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CD47Q08722 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD47Q08722 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD47Q08722 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD47Q08722 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD47Q08722 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD47Q08722 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD47Q08722 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CD47Q08722 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD47Q08722 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD47Q08722 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD47Q08722 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD47Q08722 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD47Q08722 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD47Q08722 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD47Q08722 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD47Q08722 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD47Q08722 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD47Q08722 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD47Q08722 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD47Q08722 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CD47Q08722 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD47Q08722 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD47Q08722 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD47Q08722 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CD47Q08722 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD47Q08722 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD47Q08722 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD47Q08722 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD47Q08722 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CD47Q08722 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD47Q08722 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD47Q08722 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD47Q08722 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD47Q08722 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD47Q08722 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD47Q08722 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD47Q08722 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD47Q08722 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD47Q08722 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD47Q08722 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD47Q08722 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD47Q08722 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CD47Q08722 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CD47Q08722 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CD47Q08722 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CD47Q08722 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CD47Q08722 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CD47Q08722 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CD47Q08722 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CD47Q08722 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CD47Q08722 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CD47Q08722 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CD47Q08722 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CD47Q08722 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CD47Q08722 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CD47Q08722 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CD47Q08722 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CD47Q08722 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CD47Q08722 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CD47Q08722 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CD47Q08722 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms