Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TGM3Q08188 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TGM3Q08188 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TGM3Q08188 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TGM3Q08188 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TGM3Q08188 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TGM3Q08188 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TGM3Q08188 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TGM3Q08188 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TGM3Q08188 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TGM3Q08188 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TGM3Q08188 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TGM3Q08188 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TGM3Q08188 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TGM3Q08188 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TGM3Q08188 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TGM3Q08188 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TGM3Q08188 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TGM3Q08188 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TGM3Q08188 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TGM3Q08188 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TGM3Q08188 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TGM3Q08188 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TGM3Q08188 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TGM3Q08188 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TGM3Q08188 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TGM3Q08188 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TGM3Q08188 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TGM3Q08188 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TGM3Q08188 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TGM3Q08188 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TGM3Q08188 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TGM3Q08188 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TGM3Q08188 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TGM3Q08188 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TGM3Q08188 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TGM3Q08188 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TGM3Q08188 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TGM3Q08188 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TGM3Q08188 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TGM3Q08188 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TGM3Q08188 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TGM3Q08188 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TGM3Q08188 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TGM3Q08188 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TGM3Q08188 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TGM3Q08188 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TGM3Q08188 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TGM3Q08188 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TGM3Q08188 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TGM3Q08188 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TGM3Q08188 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TGM3Q08188 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TGM3Q08188 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TGM3Q08188 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TGM3Q08188 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TGM3Q08188 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TGM3Q08188 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TGM3Q08188 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TGM3Q08188 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TGM3Q08188 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TGM3Q08188 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TGM3Q08188 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TGM3Q08188 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TGM3Q08188 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TGM3Q08188 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TGM3Q08188 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TGM3Q08188 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TGM3Q08188 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TGM3Q08188 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TGM3Q08188 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TGM3Q08188 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TGM3Q08188 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TGM3Q08188 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TGM3Q08188 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TGM3Q08188 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TGM3Q08188 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TGM3Q08188 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TGM3Q08188 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TGM3Q08188 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TGM3Q08188 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TGM3Q08188 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TGM3Q08188 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TGM3Q08188 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TGM3Q08188 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TGM3Q08188 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TGM3Q08188 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TGM3Q08188 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TGM3Q08188 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TGM3Q08188 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TGM3Q08188 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TGM3Q08188 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TGM3Q08188 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TGM3Q08188 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TGM3Q08188 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TGM3Q08188 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TGM3Q08188 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TGM3Q08188 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TGM3Q08188 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TGM3Q08188 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms