Protein–RNA interactions for Protein: Q07343

PDE4B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4BQ07343 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDE4BQ07343 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDE4BQ07343 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDE4BQ07343 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDE4BQ07343 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDE4BQ07343 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDE4BQ07343 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDE4BQ07343 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDE4BQ07343 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDE4BQ07343 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDE4BQ07343 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDE4BQ07343 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDE4BQ07343 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDE4BQ07343 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDE4BQ07343 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDE4BQ07343 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDE4BQ07343 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PDE4BQ07343 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDE4BQ07343 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDE4BQ07343 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDE4BQ07343 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDE4BQ07343 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDE4BQ07343 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDE4BQ07343 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDE4BQ07343 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDE4BQ07343 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDE4BQ07343 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDE4BQ07343 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDE4BQ07343 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDE4BQ07343 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDE4BQ07343 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDE4BQ07343 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDE4BQ07343 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDE4BQ07343 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDE4BQ07343 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDE4BQ07343 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDE4BQ07343 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDE4BQ07343 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDE4BQ07343 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDE4BQ07343 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDE4BQ07343 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PDE4BQ07343 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDE4BQ07343 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PDE4BQ07343 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDE4BQ07343 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDE4BQ07343 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDE4BQ07343 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDE4BQ07343 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDE4BQ07343 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDE4BQ07343 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDE4BQ07343 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDE4BQ07343 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDE4BQ07343 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDE4BQ07343 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDE4BQ07343 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDE4BQ07343 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDE4BQ07343 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDE4BQ07343 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDE4BQ07343 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDE4BQ07343 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDE4BQ07343 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDE4BQ07343 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDE4BQ07343 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDE4BQ07343 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDE4BQ07343 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDE4BQ07343 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PDE4BQ07343 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PDE4BQ07343 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDE4BQ07343 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PDE4BQ07343 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PDE4BQ07343 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PDE4BQ07343 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDE4BQ07343 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDE4BQ07343 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PDE4BQ07343 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PDE4BQ07343 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDE4BQ07343 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PDE4BQ07343 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PDE4BQ07343 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PDE4BQ07343 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDE4BQ07343 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PDE4BQ07343 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDE4BQ07343 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDE4BQ07343 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDE4BQ07343 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDE4BQ07343 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDE4BQ07343 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDE4BQ07343 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PDE4BQ07343 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PDE4BQ07343 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDE4BQ07343 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDE4BQ07343 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDE4BQ07343 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDE4BQ07343 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDE4BQ07343 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDE4BQ07343 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDE4BQ07343 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDE4BQ07343 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDE4BQ07343 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDE4BQ07343 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms