Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GABPB1Q06547 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GABPB1Q06547 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GABPB1Q06547 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GABPB1Q06547 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GABPB1Q06547 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GABPB1Q06547 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GABPB1Q06547 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GABPB1Q06547 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GABPB1Q06547 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GABPB1Q06547 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GABPB1Q06547 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GABPB1Q06547 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GABPB1Q06547 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GABPB1Q06547 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GABPB1Q06547 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GABPB1Q06547 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GABPB1Q06547 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GABPB1Q06547 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GABPB1Q06547 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GABPB1Q06547 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GABPB1Q06547 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GABPB1Q06547 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GABPB1Q06547 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GABPB1Q06547 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
GABPB1Q06547 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GABPB1Q06547 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GABPB1Q06547 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GABPB1Q06547 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GABPB1Q06547 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GABPB1Q06547 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GABPB1Q06547 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GABPB1Q06547 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GABPB1Q06547 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GABPB1Q06547 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GABPB1Q06547 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GABPB1Q06547 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GABPB1Q06547 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GABPB1Q06547 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GABPB1Q06547 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GABPB1Q06547 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GABPB1Q06547 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GABPB1Q06547 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GABPB1Q06547 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GABPB1Q06547 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GABPB1Q06547 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GABPB1Q06547 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GABPB1Q06547 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GABPB1Q06547 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GABPB1Q06547 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GABPB1Q06547 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
GABPB1Q06547 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GABPB1Q06547 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GABPB1Q06547 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GABPB1Q06547 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GABPB1Q06547 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GABPB1Q06547 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GABPB1Q06547 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GABPB1Q06547 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GABPB1Q06547 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GABPB1Q06547 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GABPB1Q06547 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GABPB1Q06547 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GABPB1Q06547 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GABPB1Q06547 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GABPB1Q06547 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
GABPB1Q06547 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GABPB1Q06547 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GABPB1Q06547 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GABPB1Q06547 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GABPB1Q06547 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GABPB1Q06547 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GABPB1Q06547 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GABPB1Q06547 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GABPB1Q06547 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GABPB1Q06547 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GABPB1Q06547 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GABPB1Q06547 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GABPB1Q06547 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GABPB1Q06547 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
GABPB1Q06547 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GABPB1Q06547 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GABPB1Q06547 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GABPB1Q06547 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GABPB1Q06547 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GABPB1Q06547 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GABPB1Q06547 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GABPB1Q06547 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GABPB1Q06547 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GABPB1Q06547 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GABPB1Q06547 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
GABPB1Q06547 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GABPB1Q06547 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GABPB1Q06547 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
GABPB1Q06547 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GABPB1Q06547 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GABPB1Q06547 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GABPB1Q06547 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GABPB1Q06547 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GABPB1Q06547 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms