Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GABPAQ06546 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GABPAQ06546 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GABPAQ06546 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
GABPAQ06546 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GABPAQ06546 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GABPAQ06546 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GABPAQ06546 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GABPAQ06546 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GABPAQ06546 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GABPAQ06546 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GABPAQ06546 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GABPAQ06546 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GABPAQ06546 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GABPAQ06546 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GABPAQ06546 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GABPAQ06546 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GABPAQ06546 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GABPAQ06546 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GABPAQ06546 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GABPAQ06546 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GABPAQ06546 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GABPAQ06546 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GABPAQ06546 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GABPAQ06546 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GABPAQ06546 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GABPAQ06546 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GABPAQ06546 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GABPAQ06546 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GABPAQ06546 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GABPAQ06546 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GABPAQ06546 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GABPAQ06546 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GABPAQ06546 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GABPAQ06546 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GABPAQ06546 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GABPAQ06546 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GABPAQ06546 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GABPAQ06546 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GABPAQ06546 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GABPAQ06546 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GABPAQ06546 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
GABPAQ06546 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GABPAQ06546 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GABPAQ06546 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GABPAQ06546 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GABPAQ06546 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GABPAQ06546 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GABPAQ06546 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GABPAQ06546 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GABPAQ06546 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GABPAQ06546 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GABPAQ06546 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GABPAQ06546 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GABPAQ06546 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GABPAQ06546 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
GABPAQ06546 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GABPAQ06546 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GABPAQ06546 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
GABPAQ06546 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GABPAQ06546 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GABPAQ06546 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GABPAQ06546 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GABPAQ06546 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GABPAQ06546 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GABPAQ06546 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GABPAQ06546 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GABPAQ06546 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GABPAQ06546 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GABPAQ06546 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GABPAQ06546 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GABPAQ06546 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GABPAQ06546 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GABPAQ06546 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GABPAQ06546 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GABPAQ06546 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GABPAQ06546 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GABPAQ06546 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GABPAQ06546 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GABPAQ06546 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GABPAQ06546 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
GABPAQ06546 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GABPAQ06546 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GABPAQ06546 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GABPAQ06546 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GABPAQ06546 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GABPAQ06546 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GABPAQ06546 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GABPAQ06546 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GABPAQ06546 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GABPAQ06546 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GABPAQ06546 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GABPAQ06546 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GABPAQ06546 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GABPAQ06546 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GABPAQ06546 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GABPAQ06546 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GABPAQ06546 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GABPAQ06546 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
GABPAQ06546 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms