Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRIN1Q05586 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRIN1Q05586 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRIN1Q05586 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
GRIN1Q05586 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GRIN1Q05586 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GRIN1Q05586 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GRIN1Q05586 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GRIN1Q05586 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GRIN1Q05586 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GRIN1Q05586 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GRIN1Q05586 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
GRIN1Q05586 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GRIN1Q05586 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
GRIN1Q05586 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GRIN1Q05586 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GRIN1Q05586 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GRIN1Q05586 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GRIN1Q05586 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GRIN1Q05586 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GRIN1Q05586 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRIN1Q05586 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRIN1Q05586 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRIN1Q05586 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRIN1Q05586 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRIN1Q05586 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRIN1Q05586 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRIN1Q05586 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRIN1Q05586 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRIN1Q05586 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRIN1Q05586 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRIN1Q05586 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRIN1Q05586 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRIN1Q05586 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRIN1Q05586 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRIN1Q05586 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRIN1Q05586 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRIN1Q05586 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRIN1Q05586 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRIN1Q05586 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRIN1Q05586 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRIN1Q05586 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRIN1Q05586 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRIN1Q05586 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRIN1Q05586 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRIN1Q05586 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRIN1Q05586 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRIN1Q05586 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GRIN1Q05586 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRIN1Q05586 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRIN1Q05586 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRIN1Q05586 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRIN1Q05586 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRIN1Q05586 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRIN1Q05586 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRIN1Q05586 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRIN1Q05586 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GRIN1Q05586 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRIN1Q05586 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRIN1Q05586 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRIN1Q05586 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRIN1Q05586 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRIN1Q05586 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRIN1Q05586 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GRIN1Q05586 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRIN1Q05586 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRIN1Q05586 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRIN1Q05586 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRIN1Q05586 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRIN1Q05586 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRIN1Q05586 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRIN1Q05586 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GRIN1Q05586 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRIN1Q05586 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GRIN1Q05586 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRIN1Q05586 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRIN1Q05586 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRIN1Q05586 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRIN1Q05586 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRIN1Q05586 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GRIN1Q05586 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GRIN1Q05586 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GRIN1Q05586 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GRIN1Q05586 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GRIN1Q05586 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GRIN1Q05586 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GRIN1Q05586 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GRIN1Q05586 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GRIN1Q05586 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
GRIN1Q05586 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GRIN1Q05586 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GRIN1Q05586 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GRIN1Q05586 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GRIN1Q05586 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
GRIN1Q05586 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GRIN1Q05586 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GRIN1Q05586 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GRIN1Q05586 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GRIN1Q05586 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GRIN1Q05586 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms