Protein–RNA interactions for Protein: Q03181

PPARD, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARDQ03181 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPARDQ03181 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPARDQ03181 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPARDQ03181 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPARDQ03181 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPARDQ03181 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPARDQ03181 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPARDQ03181 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPARDQ03181 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPARDQ03181 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPARDQ03181 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPARDQ03181 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPARDQ03181 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPARDQ03181 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPARDQ03181 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPARDQ03181 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPARDQ03181 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPARDQ03181 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPARDQ03181 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PPARDQ03181 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PPARDQ03181 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPARDQ03181 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPARDQ03181 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPARDQ03181 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPARDQ03181 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPARDQ03181 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPARDQ03181 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPARDQ03181 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPARDQ03181 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPARDQ03181 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPARDQ03181 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPARDQ03181 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPARDQ03181 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPARDQ03181 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPARDQ03181 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPARDQ03181 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPARDQ03181 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPARDQ03181 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPARDQ03181 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PPARDQ03181 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPARDQ03181 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PPARDQ03181 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPARDQ03181 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPARDQ03181 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPARDQ03181 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPARDQ03181 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPARDQ03181 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPARDQ03181 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPARDQ03181 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPARDQ03181 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPARDQ03181 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PPARDQ03181 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPARDQ03181 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPARDQ03181 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPARDQ03181 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPARDQ03181 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPARDQ03181 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPARDQ03181 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPARDQ03181 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPARDQ03181 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPARDQ03181 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPARDQ03181 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPARDQ03181 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPARDQ03181 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPARDQ03181 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPARDQ03181 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPARDQ03181 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPARDQ03181 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPARDQ03181 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPARDQ03181 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPARDQ03181 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPARDQ03181 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPARDQ03181 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPARDQ03181 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPARDQ03181 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPARDQ03181 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPARDQ03181 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPARDQ03181 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPARDQ03181 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPARDQ03181 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPARDQ03181 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPARDQ03181 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPARDQ03181 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPARDQ03181 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPARDQ03181 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPARDQ03181 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPARDQ03181 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPARDQ03181 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPARDQ03181 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPARDQ03181 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPARDQ03181 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPARDQ03181 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPARDQ03181 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPARDQ03181 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPARDQ03181 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPARDQ03181 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPARDQ03181 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PPARDQ03181 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPARDQ03181 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPARDQ03181 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms