Protein–RNA interactions for Protein: Q01959

SLC6A3, Sodium-dependent dopamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A3Q01959 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC6A3Q01959 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC6A3Q01959 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC6A3Q01959 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC6A3Q01959 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC6A3Q01959 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC6A3Q01959 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC6A3Q01959 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC6A3Q01959 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC6A3Q01959 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC6A3Q01959 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC6A3Q01959 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC6A3Q01959 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC6A3Q01959 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC6A3Q01959 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC6A3Q01959 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC6A3Q01959 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC6A3Q01959 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC6A3Q01959 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC6A3Q01959 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC6A3Q01959 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SLC6A3Q01959 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SLC6A3Q01959 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SLC6A3Q01959 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SLC6A3Q01959 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SLC6A3Q01959 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SLC6A3Q01959 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SLC6A3Q01959 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC6A3Q01959 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC6A3Q01959 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC6A3Q01959 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC6A3Q01959 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC6A3Q01959 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC6A3Q01959 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC6A3Q01959 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC6A3Q01959 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC6A3Q01959 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC6A3Q01959 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC6A3Q01959 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC6A3Q01959 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC6A3Q01959 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC6A3Q01959 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC6A3Q01959 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC6A3Q01959 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC6A3Q01959 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC6A3Q01959 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC6A3Q01959 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC6A3Q01959 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC6A3Q01959 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC6A3Q01959 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC6A3Q01959 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC6A3Q01959 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC6A3Q01959 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC6A3Q01959 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC6A3Q01959 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC6A3Q01959 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC6A3Q01959 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC6A3Q01959 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC6A3Q01959 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC6A3Q01959 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC6A3Q01959 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC6A3Q01959 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC6A3Q01959 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC6A3Q01959 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC6A3Q01959 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC6A3Q01959 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC6A3Q01959 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC6A3Q01959 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC6A3Q01959 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC6A3Q01959 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC6A3Q01959 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC6A3Q01959 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC6A3Q01959 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC6A3Q01959 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC6A3Q01959 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC6A3Q01959 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC6A3Q01959 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC6A3Q01959 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC6A3Q01959 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC6A3Q01959 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC6A3Q01959 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC6A3Q01959 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC6A3Q01959 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC6A3Q01959 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC6A3Q01959 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC6A3Q01959 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC6A3Q01959 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC6A3Q01959 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC6A3Q01959 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC6A3Q01959 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC6A3Q01959 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC6A3Q01959 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC6A3Q01959 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC6A3Q01959 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC6A3Q01959 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC6A3Q01959 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC6A3Q01959 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC6A3Q01959 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC6A3Q01959 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC6A3Q01959 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms