Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPTBN1Q01082 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPTBN1Q01082 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SPTBN1Q01082 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPTBN1Q01082 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SPTBN1Q01082 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPTBN1Q01082 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPTBN1Q01082 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPTBN1Q01082 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPTBN1Q01082 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPTBN1Q01082 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPTBN1Q01082 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SPTBN1Q01082 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPTBN1Q01082 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPTBN1Q01082 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPTBN1Q01082 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPTBN1Q01082 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPTBN1Q01082 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SPTBN1Q01082 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPTBN1Q01082 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPTBN1Q01082 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPTBN1Q01082 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPTBN1Q01082 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPTBN1Q01082 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPTBN1Q01082 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SPTBN1Q01082 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SPTBN1Q01082 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPTBN1Q01082 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.34
SPTBN1Q01082 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
SPTBN1Q01082 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPTBN1Q01082 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPTBN1Q01082 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPTBN1Q01082 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPTBN1Q01082 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPTBN1Q01082 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPTBN1Q01082 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SPTBN1Q01082 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SPTBN1Q01082 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPTBN1Q01082 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPTBN1Q01082 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPTBN1Q01082 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPTBN1Q01082 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPTBN1Q01082 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPTBN1Q01082 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPTBN1Q01082 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPTBN1Q01082 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPTBN1Q01082 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPTBN1Q01082 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPTBN1Q01082 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPTBN1Q01082 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPTBN1Q01082 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPTBN1Q01082 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SPTBN1Q01082 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPTBN1Q01082 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPTBN1Q01082 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPTBN1Q01082 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPTBN1Q01082 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPTBN1Q01082 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPTBN1Q01082 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPTBN1Q01082 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPTBN1Q01082 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPTBN1Q01082 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPTBN1Q01082 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPTBN1Q01082 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPTBN1Q01082 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPTBN1Q01082 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPTBN1Q01082 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPTBN1Q01082 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPTBN1Q01082 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SPTBN1Q01082 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPTBN1Q01082 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SPTBN1Q01082 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPTBN1Q01082 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPTBN1Q01082 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SPTBN1Q01082 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPTBN1Q01082 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPTBN1Q01082 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPTBN1Q01082 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPTBN1Q01082 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPTBN1Q01082 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPTBN1Q01082 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPTBN1Q01082 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPTBN1Q01082 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPTBN1Q01082 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPTBN1Q01082 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPTBN1Q01082 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPTBN1Q01082 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPTBN1Q01082 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPTBN1Q01082 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPTBN1Q01082 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPTBN1Q01082 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPTBN1Q01082 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPTBN1Q01082 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPTBN1Q01082 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPTBN1Q01082 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SPTBN1Q01082 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SPTBN1Q01082 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPTBN1Q01082 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPTBN1Q01082 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPTBN1Q01082 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms