Protein–RNA interactions for Protein: Q00526

CDK3, Cyclin-dependent kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK3Q00526 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDK3Q00526 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDK3Q00526 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDK3Q00526 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDK3Q00526 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDK3Q00526 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDK3Q00526 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDK3Q00526 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDK3Q00526 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDK3Q00526 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDK3Q00526 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDK3Q00526 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDK3Q00526 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDK3Q00526 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDK3Q00526 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDK3Q00526 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDK3Q00526 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDK3Q00526 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDK3Q00526 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDK3Q00526 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDK3Q00526 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDK3Q00526 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDK3Q00526 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDK3Q00526 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDK3Q00526 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDK3Q00526 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDK3Q00526 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CDK3Q00526 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDK3Q00526 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDK3Q00526 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDK3Q00526 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDK3Q00526 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CDK3Q00526 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDK3Q00526 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDK3Q00526 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDK3Q00526 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CDK3Q00526 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDK3Q00526 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDK3Q00526 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDK3Q00526 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDK3Q00526 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDK3Q00526 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDK3Q00526 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDK3Q00526 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDK3Q00526 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDK3Q00526 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDK3Q00526 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDK3Q00526 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDK3Q00526 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDK3Q00526 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDK3Q00526 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDK3Q00526 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDK3Q00526 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDK3Q00526 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDK3Q00526 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDK3Q00526 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDK3Q00526 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDK3Q00526 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDK3Q00526 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDK3Q00526 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDK3Q00526 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDK3Q00526 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDK3Q00526 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDK3Q00526 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDK3Q00526 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDK3Q00526 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDK3Q00526 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDK3Q00526 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDK3Q00526 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CDK3Q00526 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDK3Q00526 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDK3Q00526 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDK3Q00526 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CDK3Q00526 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDK3Q00526 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CDK3Q00526 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDK3Q00526 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDK3Q00526 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDK3Q00526 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDK3Q00526 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDK3Q00526 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDK3Q00526 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDK3Q00526 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDK3Q00526 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDK3Q00526 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDK3Q00526 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDK3Q00526 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDK3Q00526 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDK3Q00526 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDK3Q00526 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDK3Q00526 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDK3Q00526 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDK3Q00526 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDK3Q00526 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDK3Q00526 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDK3Q00526 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDK3Q00526 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDK3Q00526 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CDK3Q00526 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDK3Q00526 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms