Protein–RNA interactions for Protein: P84550

SKOR1, SKI family transcriptional corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR1P84550 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SKOR1P84550 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SKOR1P84550 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SKOR1P84550 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SKOR1P84550 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SKOR1P84550 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SKOR1P84550 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SKOR1P84550 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SKOR1P84550 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SKOR1P84550 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SKOR1P84550 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SKOR1P84550 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SKOR1P84550 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SKOR1P84550 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SKOR1P84550 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SKOR1P84550 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SKOR1P84550 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SKOR1P84550 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SKOR1P84550 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SKOR1P84550 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SKOR1P84550 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SKOR1P84550 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SKOR1P84550 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SKOR1P84550 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SKOR1P84550 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SKOR1P84550 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SKOR1P84550 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SKOR1P84550 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SKOR1P84550 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SKOR1P84550 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SKOR1P84550 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SKOR1P84550 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SKOR1P84550 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SKOR1P84550 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SKOR1P84550 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SKOR1P84550 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SKOR1P84550 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SKOR1P84550 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SKOR1P84550 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SKOR1P84550 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SKOR1P84550 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SKOR1P84550 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SKOR1P84550 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SKOR1P84550 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SKOR1P84550 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SKOR1P84550 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SKOR1P84550 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SKOR1P84550 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SKOR1P84550 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SKOR1P84550 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SKOR1P84550 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SKOR1P84550 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SKOR1P84550 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SKOR1P84550 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SKOR1P84550 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SKOR1P84550 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SKOR1P84550 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SKOR1P84550 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SKOR1P84550 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SKOR1P84550 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SKOR1P84550 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SKOR1P84550 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SKOR1P84550 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SKOR1P84550 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SKOR1P84550 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SKOR1P84550 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SKOR1P84550 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SKOR1P84550 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SKOR1P84550 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SKOR1P84550 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SKOR1P84550 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SKOR1P84550 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SKOR1P84550 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SKOR1P84550 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SKOR1P84550 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SKOR1P84550 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SKOR1P84550 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SKOR1P84550 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SKOR1P84550 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SKOR1P84550 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SKOR1P84550 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SKOR1P84550 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SKOR1P84550 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SKOR1P84550 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SKOR1P84550 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SKOR1P84550 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SKOR1P84550 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SKOR1P84550 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SKOR1P84550 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SKOR1P84550 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SKOR1P84550 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SKOR1P84550 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SKOR1P84550 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SKOR1P84550 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SKOR1P84550 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SKOR1P84550 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SKOR1P84550 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SKOR1P84550 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SKOR1P84550 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SKOR1P84550 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms