Protein–RNA interactions for Protein: P56202

CTSW, Cathepsin W, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSWP56202 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTSWP56202 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTSWP56202 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTSWP56202 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CTSWP56202 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTSWP56202 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTSWP56202 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTSWP56202 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTSWP56202 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTSWP56202 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTSWP56202 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTSWP56202 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTSWP56202 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTSWP56202 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTSWP56202 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTSWP56202 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTSWP56202 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTSWP56202 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTSWP56202 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTSWP56202 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CTSWP56202 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CTSWP56202 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CTSWP56202 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTSWP56202 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTSWP56202 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTSWP56202 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CTSWP56202 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTSWP56202 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTSWP56202 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTSWP56202 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTSWP56202 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTSWP56202 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTSWP56202 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTSWP56202 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTSWP56202 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTSWP56202 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTSWP56202 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTSWP56202 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTSWP56202 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CTSWP56202 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTSWP56202 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CTSWP56202 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTSWP56202 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTSWP56202 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTSWP56202 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTSWP56202 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTSWP56202 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTSWP56202 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTSWP56202 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CTSWP56202 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTSWP56202 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTSWP56202 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTSWP56202 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTSWP56202 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTSWP56202 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTSWP56202 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTSWP56202 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTSWP56202 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CTSWP56202 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTSWP56202 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTSWP56202 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTSWP56202 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTSWP56202 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTSWP56202 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTSWP56202 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTSWP56202 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTSWP56202 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTSWP56202 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTSWP56202 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTSWP56202 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTSWP56202 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTSWP56202 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTSWP56202 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CTSWP56202 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTSWP56202 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTSWP56202 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTSWP56202 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTSWP56202 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTSWP56202 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTSWP56202 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CTSWP56202 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTSWP56202 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTSWP56202 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTSWP56202 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTSWP56202 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTSWP56202 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CTSWP56202 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTSWP56202 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTSWP56202 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTSWP56202 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTSWP56202 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTSWP56202 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTSWP56202 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTSWP56202 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTSWP56202 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTSWP56202 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTSWP56202 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTSWP56202 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTSWP56202 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTSWP56202 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms