Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SH3BGRP55822 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SH3BGRP55822 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SH3BGRP55822 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SH3BGRP55822 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SH3BGRP55822 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SH3BGRP55822 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SH3BGRP55822 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SH3BGRP55822 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SH3BGRP55822 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SH3BGRP55822 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SH3BGRP55822 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SH3BGRP55822 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SH3BGRP55822 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SH3BGRP55822 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SH3BGRP55822 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SH3BGRP55822 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SH3BGRP55822 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SH3BGRP55822 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SH3BGRP55822 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SH3BGRP55822 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SH3BGRP55822 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SH3BGRP55822 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SH3BGRP55822 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SH3BGRP55822 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SH3BGRP55822 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SH3BGRP55822 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SH3BGRP55822 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SH3BGRP55822 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SH3BGRP55822 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SH3BGRP55822 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SH3BGRP55822 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SH3BGRP55822 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SH3BGRP55822 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SH3BGRP55822 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SH3BGRP55822 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SH3BGRP55822 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SH3BGRP55822 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SH3BGRP55822 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SH3BGRP55822 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SH3BGRP55822 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SH3BGRP55822 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SH3BGRP55822 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SH3BGRP55822 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SH3BGRP55822 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SH3BGRP55822 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SH3BGRP55822 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SH3BGRP55822 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SH3BGRP55822 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SH3BGRP55822 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SH3BGRP55822 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SH3BGRP55822 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SH3BGRP55822 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SH3BGRP55822 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SH3BGRP55822 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SH3BGRP55822 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SH3BGRP55822 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SH3BGRP55822 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SH3BGRP55822 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SH3BGRP55822 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SH3BGRP55822 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SH3BGRP55822 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SH3BGRP55822 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SH3BGRP55822 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SH3BGRP55822 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SH3BGRP55822 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SH3BGRP55822 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SH3BGRP55822 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SH3BGRP55822 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SH3BGRP55822 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SH3BGRP55822 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SH3BGRP55822 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SH3BGRP55822 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SH3BGRP55822 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SH3BGRP55822 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SH3BGRP55822 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SH3BGRP55822 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SH3BGRP55822 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SH3BGRP55822 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SH3BGRP55822 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SH3BGRP55822 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SH3BGRP55822 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SH3BGRP55822 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SH3BGRP55822 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SH3BGRP55822 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SH3BGRP55822 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SH3BGRP55822 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SH3BGRP55822 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SH3BGRP55822 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SH3BGRP55822 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SH3BGRP55822 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SH3BGRP55822 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SH3BGRP55822 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SH3BGRP55822 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SH3BGRP55822 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SH3BGRP55822 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SH3BGRP55822 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SH3BGRP55822 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SH3BGRP55822 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SH3BGRP55822 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms