Protein–RNA interactions for Protein: P46020

PHKA1, Phosphorylase b kinase regulatory subunit alpha, skeletal muscle isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHKA1P46020 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PHKA1P46020 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PHKA1P46020 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PHKA1P46020 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PHKA1P46020 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PHKA1P46020 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PHKA1P46020 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PHKA1P46020 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PHKA1P46020 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PHKA1P46020 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PHKA1P46020 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PHKA1P46020 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PHKA1P46020 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PHKA1P46020 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PHKA1P46020 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PHKA1P46020 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PHKA1P46020 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PHKA1P46020 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PHKA1P46020 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PHKA1P46020 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PHKA1P46020 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PHKA1P46020 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PHKA1P46020 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PHKA1P46020 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PHKA1P46020 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PHKA1P46020 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PHKA1P46020 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PHKA1P46020 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PHKA1P46020 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PHKA1P46020 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PHKA1P46020 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PHKA1P46020 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PHKA1P46020 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PHKA1P46020 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PHKA1P46020 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PHKA1P46020 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PHKA1P46020 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PHKA1P46020 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PHKA1P46020 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PHKA1P46020 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PHKA1P46020 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PHKA1P46020 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PHKA1P46020 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PHKA1P46020 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PHKA1P46020 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PHKA1P46020 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PHKA1P46020 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PHKA1P46020 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PHKA1P46020 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PHKA1P46020 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PHKA1P46020 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PHKA1P46020 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PHKA1P46020 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PHKA1P46020 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PHKA1P46020 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PHKA1P46020 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PHKA1P46020 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PHKA1P46020 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PHKA1P46020 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PHKA1P46020 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PHKA1P46020 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PHKA1P46020 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PHKA1P46020 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PHKA1P46020 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PHKA1P46020 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PHKA1P46020 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PHKA1P46020 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PHKA1P46020 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PHKA1P46020 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PHKA1P46020 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PHKA1P46020 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PHKA1P46020 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PHKA1P46020 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PHKA1P46020 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PHKA1P46020 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PHKA1P46020 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PHKA1P46020 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PHKA1P46020 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PHKA1P46020 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PHKA1P46020 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PHKA1P46020 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHKA1P46020 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHKA1P46020 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHKA1P46020 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PHKA1P46020 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHKA1P46020 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHKA1P46020 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHKA1P46020 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHKA1P46020 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHKA1P46020 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHKA1P46020 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHKA1P46020 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHKA1P46020 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHKA1P46020 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHKA1P46020 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHKA1P46020 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHKA1P46020 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHKA1P46020 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHKA1P46020 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHKA1P46020 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms