Protein–RNA interactions for Protein: P36405

ARL3, ADP-ribosylation factor-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL3P36405 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARL3P36405 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARL3P36405 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARL3P36405 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARL3P36405 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARL3P36405 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARL3P36405 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARL3P36405 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARL3P36405 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARL3P36405 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARL3P36405 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARL3P36405 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARL3P36405 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARL3P36405 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARL3P36405 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARL3P36405 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARL3P36405 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARL3P36405 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARL3P36405 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARL3P36405 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ARL3P36405 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARL3P36405 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARL3P36405 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARL3P36405 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARL3P36405 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARL3P36405 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARL3P36405 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARL3P36405 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARL3P36405 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARL3P36405 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARL3P36405 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARL3P36405 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARL3P36405 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARL3P36405 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARL3P36405 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARL3P36405 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARL3P36405 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARL3P36405 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARL3P36405 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARL3P36405 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARL3P36405 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARL3P36405 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARL3P36405 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARL3P36405 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARL3P36405 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARL3P36405 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARL3P36405 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARL3P36405 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARL3P36405 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARL3P36405 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARL3P36405 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARL3P36405 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARL3P36405 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARL3P36405 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARL3P36405 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARL3P36405 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARL3P36405 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARL3P36405 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ARL3P36405 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARL3P36405 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ARL3P36405 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARL3P36405 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARL3P36405 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARL3P36405 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARL3P36405 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARL3P36405 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARL3P36405 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARL3P36405 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARL3P36405 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARL3P36405 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARL3P36405 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARL3P36405 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARL3P36405 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARL3P36405 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARL3P36405 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARL3P36405 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARL3P36405 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARL3P36405 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARL3P36405 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARL3P36405 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARL3P36405 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARL3P36405 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARL3P36405 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARL3P36405 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARL3P36405 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARL3P36405 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ARL3P36405 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARL3P36405 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ARL3P36405 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARL3P36405 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARL3P36405 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARL3P36405 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARL3P36405 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARL3P36405 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARL3P36405 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARL3P36405 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARL3P36405 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARL3P36405 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARL3P36405 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARL3P36405 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms