Protein–RNA interactions for Protein: P35913

PDE6B, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6BP35913 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE6BP35913 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE6BP35913 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE6BP35913 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE6BP35913 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE6BP35913 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE6BP35913 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE6BP35913 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE6BP35913 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE6BP35913 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE6BP35913 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDE6BP35913 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDE6BP35913 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDE6BP35913 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDE6BP35913 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDE6BP35913 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDE6BP35913 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDE6BP35913 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDE6BP35913 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDE6BP35913 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PDE6BP35913 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDE6BP35913 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDE6BP35913 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDE6BP35913 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDE6BP35913 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDE6BP35913 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PDE6BP35913 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDE6BP35913 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDE6BP35913 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDE6BP35913 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDE6BP35913 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDE6BP35913 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDE6BP35913 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDE6BP35913 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDE6BP35913 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PDE6BP35913 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDE6BP35913 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDE6BP35913 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDE6BP35913 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDE6BP35913 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDE6BP35913 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDE6BP35913 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDE6BP35913 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDE6BP35913 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDE6BP35913 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDE6BP35913 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDE6BP35913 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDE6BP35913 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDE6BP35913 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDE6BP35913 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDE6BP35913 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDE6BP35913 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDE6BP35913 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDE6BP35913 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDE6BP35913 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDE6BP35913 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDE6BP35913 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDE6BP35913 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDE6BP35913 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDE6BP35913 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDE6BP35913 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDE6BP35913 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDE6BP35913 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDE6BP35913 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDE6BP35913 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PDE6BP35913 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PDE6BP35913 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDE6BP35913 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDE6BP35913 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDE6BP35913 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDE6BP35913 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDE6BP35913 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDE6BP35913 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDE6BP35913 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDE6BP35913 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDE6BP35913 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDE6BP35913 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDE6BP35913 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDE6BP35913 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDE6BP35913 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDE6BP35913 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDE6BP35913 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDE6BP35913 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDE6BP35913 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PDE6BP35913 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDE6BP35913 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDE6BP35913 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDE6BP35913 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDE6BP35913 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDE6BP35913 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDE6BP35913 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDE6BP35913 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDE6BP35913 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDE6BP35913 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PDE6BP35913 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDE6BP35913 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDE6BP35913 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
PDE6BP35913 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDE6BP35913 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDE6BP35913 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms