Protein–RNA interactions for Protein: P33527

ABCC1, Multidrug resistance-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC1P33527 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ABCC1P33527 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ABCC1P33527 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ABCC1P33527 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ABCC1P33527 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ABCC1P33527 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ABCC1P33527 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ABCC1P33527 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ABCC1P33527 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ABCC1P33527 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ABCC1P33527 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ABCC1P33527 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ABCC1P33527 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ABCC1P33527 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ABCC1P33527 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ABCC1P33527 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ABCC1P33527 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ABCC1P33527 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ABCC1P33527 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ABCC1P33527 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
ABCC1P33527 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ABCC1P33527 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ABCC1P33527 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ABCC1P33527 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ABCC1P33527 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ABCC1P33527 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ABCC1P33527 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ABCC1P33527 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ABCC1P33527 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ABCC1P33527 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ABCC1P33527 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ABCC1P33527 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ABCC1P33527 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
ABCC1P33527 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ABCC1P33527 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ABCC1P33527 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ABCC1P33527 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ABCC1P33527 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ABCC1P33527 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ABCC1P33527 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ABCC1P33527 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ABCC1P33527 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ABCC1P33527 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ABCC1P33527 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
ABCC1P33527 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ABCC1P33527 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ABCC1P33527 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ABCC1P33527 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ABCC1P33527 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ABCC1P33527 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ABCC1P33527 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ABCC1P33527 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ABCC1P33527 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
ABCC1P33527 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ABCC1P33527 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ABCC1P33527 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ABCC1P33527 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ABCC1P33527 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
ABCC1P33527 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ABCC1P33527 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ABCC1P33527 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ABCC1P33527 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
ABCC1P33527 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ABCC1P33527 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ABCC1P33527 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ABCC1P33527 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ABCC1P33527 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ABCC1P33527 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ABCC1P33527 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ABCC1P33527 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ABCC1P33527 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
ABCC1P33527 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ABCC1P33527 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ABCC1P33527 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ABCC1P33527 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ABCC1P33527 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ABCC1P33527 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ABCC1P33527 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ABCC1P33527 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
ABCC1P33527 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ABCC1P33527 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ABCC1P33527 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ABCC1P33527 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ABCC1P33527 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ABCC1P33527 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ABCC1P33527 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ABCC1P33527 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ABCC1P33527 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ABCC1P33527 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ABCC1P33527 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ABCC1P33527 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ABCC1P33527 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
ABCC1P33527 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ABCC1P33527 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ABCC1P33527 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ABCC1P33527 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ABCC1P33527 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ABCC1P33527 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ABCC1P33527 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ABCC1P33527 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms