Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXA7P31268 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXA7P31268 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXA7P31268 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXA7P31268 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXA7P31268 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXA7P31268 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXA7P31268 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXA7P31268 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXA7P31268 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXA7P31268 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXA7P31268 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXA7P31268 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXA7P31268 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXA7P31268 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXA7P31268 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXA7P31268 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXA7P31268 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXA7P31268 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXA7P31268 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXA7P31268 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXA7P31268 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXA7P31268 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXA7P31268 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXA7P31268 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXA7P31268 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXA7P31268 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXA7P31268 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXA7P31268 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXA7P31268 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXA7P31268 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXA7P31268 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXA7P31268 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXA7P31268 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXA7P31268 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXA7P31268 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXA7P31268 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXA7P31268 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXA7P31268 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXA7P31268 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXA7P31268 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXA7P31268 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXA7P31268 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXA7P31268 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXA7P31268 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXA7P31268 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXA7P31268 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXA7P31268 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXA7P31268 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXA7P31268 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXA7P31268 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXA7P31268 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXA7P31268 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXA7P31268 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXA7P31268 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXA7P31268 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXA7P31268 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXA7P31268 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXA7P31268 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXA7P31268 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXA7P31268 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXA7P31268 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXA7P31268 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXA7P31268 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXA7P31268 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXA7P31268 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXA7P31268 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXA7P31268 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXA7P31268 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXA7P31268 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXA7P31268 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXA7P31268 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXA7P31268 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXA7P31268 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXA7P31268 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXA7P31268 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXA7P31268 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXA7P31268 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXA7P31268 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXA7P31268 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXA7P31268 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXA7P31268 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXA7P31268 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXA7P31268 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXA7P31268 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXA7P31268 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXA7P31268 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXA7P31268 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXA7P31268 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXA7P31268 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXA7P31268 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXA7P31268 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXA7P31268 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXA7P31268 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXA7P31268 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXA7P31268 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXA7P31268 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXA7P31268 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXA7P31268 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXA7P31268 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms