Protein–RNA interactions for Protein: P30408

TM4SF1, Transmembrane 4 L6 family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF1P30408 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TM4SF1P30408 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TM4SF1P30408 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TM4SF1P30408 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TM4SF1P30408 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TM4SF1P30408 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TM4SF1P30408 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TM4SF1P30408 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TM4SF1P30408 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TM4SF1P30408 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TM4SF1P30408 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TM4SF1P30408 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TM4SF1P30408 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TM4SF1P30408 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TM4SF1P30408 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TM4SF1P30408 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TM4SF1P30408 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TM4SF1P30408 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TM4SF1P30408 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TM4SF1P30408 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TM4SF1P30408 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TM4SF1P30408 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TM4SF1P30408 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TM4SF1P30408 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TM4SF1P30408 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TM4SF1P30408 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TM4SF1P30408 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TM4SF1P30408 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TM4SF1P30408 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TM4SF1P30408 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TM4SF1P30408 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TM4SF1P30408 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TM4SF1P30408 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TM4SF1P30408 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TM4SF1P30408 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TM4SF1P30408 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TM4SF1P30408 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TM4SF1P30408 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TM4SF1P30408 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TM4SF1P30408 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TM4SF1P30408 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TM4SF1P30408 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TM4SF1P30408 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TM4SF1P30408 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TM4SF1P30408 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TM4SF1P30408 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TM4SF1P30408 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TM4SF1P30408 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TM4SF1P30408 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TM4SF1P30408 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TM4SF1P30408 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TM4SF1P30408 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TM4SF1P30408 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TM4SF1P30408 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TM4SF1P30408 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TM4SF1P30408 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TM4SF1P30408 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TM4SF1P30408 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TM4SF1P30408 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TM4SF1P30408 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TM4SF1P30408 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TM4SF1P30408 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TM4SF1P30408 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TM4SF1P30408 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TM4SF1P30408 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TM4SF1P30408 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TM4SF1P30408 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TM4SF1P30408 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TM4SF1P30408 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TM4SF1P30408 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TM4SF1P30408 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TM4SF1P30408 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TM4SF1P30408 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TM4SF1P30408 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TM4SF1P30408 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TM4SF1P30408 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TM4SF1P30408 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TM4SF1P30408 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TM4SF1P30408 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TM4SF1P30408 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TM4SF1P30408 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TM4SF1P30408 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TM4SF1P30408 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TM4SF1P30408 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TM4SF1P30408 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TM4SF1P30408 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TM4SF1P30408 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TM4SF1P30408 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TM4SF1P30408 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TM4SF1P30408 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TM4SF1P30408 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TM4SF1P30408 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TM4SF1P30408 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TM4SF1P30408 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TM4SF1P30408 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TM4SF1P30408 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TM4SF1P30408 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TM4SF1P30408 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TM4SF1P30408 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TM4SF1P30408 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms