Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ARID4AP29374 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARID4AP29374 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARID4AP29374 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARID4AP29374 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARID4AP29374 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARID4AP29374 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ARID4AP29374 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
ARID4AP29374 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ARID4AP29374 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARID4AP29374 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARID4AP29374 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARID4AP29374 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARID4AP29374 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARID4AP29374 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARID4AP29374 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARID4AP29374 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARID4AP29374 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARID4AP29374 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARID4AP29374 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARID4AP29374 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARID4AP29374 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARID4AP29374 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARID4AP29374 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARID4AP29374 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARID4AP29374 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARID4AP29374 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ARID4AP29374 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARID4AP29374 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARID4AP29374 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARID4AP29374 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARID4AP29374 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARID4AP29374 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARID4AP29374 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARID4AP29374 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ARID4AP29374 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARID4AP29374 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARID4AP29374 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARID4AP29374 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARID4AP29374 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARID4AP29374 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARID4AP29374 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARID4AP29374 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARID4AP29374 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARID4AP29374 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARID4AP29374 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARID4AP29374 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARID4AP29374 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARID4AP29374 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARID4AP29374 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARID4AP29374 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARID4AP29374 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARID4AP29374 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARID4AP29374 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARID4AP29374 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARID4AP29374 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARID4AP29374 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARID4AP29374 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARID4AP29374 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARID4AP29374 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARID4AP29374 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARID4AP29374 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARID4AP29374 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARID4AP29374 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARID4AP29374 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARID4AP29374 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARID4AP29374 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARID4AP29374 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARID4AP29374 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARID4AP29374 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARID4AP29374 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARID4AP29374 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARID4AP29374 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARID4AP29374 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARID4AP29374 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARID4AP29374 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARID4AP29374 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARID4AP29374 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARID4AP29374 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARID4AP29374 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARID4AP29374 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARID4AP29374 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARID4AP29374 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARID4AP29374 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARID4AP29374 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARID4AP29374 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARID4AP29374 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARID4AP29374 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ARID4AP29374 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARID4AP29374 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARID4AP29374 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARID4AP29374 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARID4AP29374 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARID4AP29374 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARID4AP29374 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARID4AP29374 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ARID4AP29374 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARID4AP29374 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARID4AP29374 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARID4AP29374 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms