Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GCAP28676 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GCAP28676 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GCAP28676 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GCAP28676 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GCAP28676 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GCAP28676 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GCAP28676 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GCAP28676 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GCAP28676 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GCAP28676 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GCAP28676 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GCAP28676 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GCAP28676 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GCAP28676 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GCAP28676 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
GCAP28676 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GCAP28676 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GCAP28676 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GCAP28676 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GCAP28676 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
GCAP28676 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GCAP28676 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
GCAP28676 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
GCAP28676 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GCAP28676 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GCAP28676 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GCAP28676 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
GCAP28676 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GCAP28676 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GCAP28676 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GCAP28676 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GCAP28676 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GCAP28676 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GCAP28676 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GCAP28676 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GCAP28676 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GCAP28676 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GCAP28676 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GCAP28676 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GCAP28676 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
GCAP28676 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GCAP28676 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GCAP28676 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GCAP28676 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GCAP28676 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GCAP28676 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GCAP28676 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GCAP28676 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GCAP28676 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GCAP28676 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GCAP28676 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GCAP28676 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GCAP28676 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GCAP28676 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GCAP28676 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GCAP28676 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GCAP28676 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GCAP28676 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GCAP28676 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GCAP28676 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GCAP28676 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GCAP28676 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GCAP28676 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GCAP28676 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GCAP28676 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GCAP28676 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GCAP28676 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GCAP28676 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GCAP28676 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
GCAP28676 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GCAP28676 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GCAP28676 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GCAP28676 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
GCAP28676 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GCAP28676 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GCAP28676 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GCAP28676 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
GCAP28676 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GCAP28676 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GCAP28676 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GCAP28676 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GCAP28676 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GCAP28676 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
GCAP28676 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GCAP28676 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GCAP28676 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GCAP28676 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GCAP28676 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GCAP28676 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GCAP28676 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GCAP28676 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GCAP28676 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GCAP28676 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GCAP28676 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GCAP28676 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GCAP28676 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GCAP28676 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GCAP28676 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GCAP28676 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms