Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PSMB4P28070 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PSMB4P28070 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PSMB4P28070 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PSMB4P28070 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PSMB4P28070 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PSMB4P28070 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PSMB4P28070 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PSMB4P28070 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PSMB4P28070 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PSMB4P28070 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PSMB4P28070 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PSMB4P28070 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
PSMB4P28070 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PSMB4P28070 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
PSMB4P28070 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PSMB4P28070 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PSMB4P28070 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PSMB4P28070 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PSMB4P28070 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PSMB4P28070 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PSMB4P28070 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PSMB4P28070 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PSMB4P28070 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PSMB4P28070 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PSMB4P28070 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PSMB4P28070 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PSMB4P28070 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PSMB4P28070 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PSMB4P28070 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PSMB4P28070 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PSMB4P28070 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PSMB4P28070 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PSMB4P28070 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PSMB4P28070 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PSMB4P28070 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PSMB4P28070 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PSMB4P28070 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PSMB4P28070 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PSMB4P28070 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PSMB4P28070 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PSMB4P28070 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PSMB4P28070 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PSMB4P28070 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PSMB4P28070 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PSMB4P28070 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PSMB4P28070 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PSMB4P28070 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PSMB4P28070 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PSMB4P28070 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PSMB4P28070 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PSMB4P28070 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PSMB4P28070 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PSMB4P28070 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PSMB4P28070 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PSMB4P28070 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PSMB4P28070 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PSMB4P28070 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PSMB4P28070 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PSMB4P28070 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PSMB4P28070 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PSMB4P28070 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PSMB4P28070 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PSMB4P28070 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PSMB4P28070 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PSMB4P28070 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
PSMB4P28070 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PSMB4P28070 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PSMB4P28070 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PSMB4P28070 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PSMB4P28070 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PSMB4P28070 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PSMB4P28070 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PSMB4P28070 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PSMB4P28070 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PSMB4P28070 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PSMB4P28070 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PSMB4P28070 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PSMB4P28070 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PSMB4P28070 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PSMB4P28070 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
PSMB4P28070 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PSMB4P28070 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PSMB4P28070 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PSMB4P28070 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PSMB4P28070 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PSMB4P28070 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PSMB4P28070 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PSMB4P28070 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PSMB4P28070 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PSMB4P28070 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PSMB4P28070 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
PSMB4P28070 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PSMB4P28070 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PSMB4P28070 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PSMB4P28070 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PSMB4P28070 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PSMB4P28070 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PSMB4P28070 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PSMB4P28070 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms