Protein–RNA interactions for Protein: P17812

CTPS1, CTP synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1P17812 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTPS1P17812 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTPS1P17812 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTPS1P17812 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTPS1P17812 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTPS1P17812 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTPS1P17812 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTPS1P17812 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTPS1P17812 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTPS1P17812 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTPS1P17812 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CTPS1P17812 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTPS1P17812 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTPS1P17812 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CTPS1P17812 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTPS1P17812 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTPS1P17812 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTPS1P17812 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTPS1P17812 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTPS1P17812 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTPS1P17812 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTPS1P17812 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTPS1P17812 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTPS1P17812 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTPS1P17812 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTPS1P17812 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTPS1P17812 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTPS1P17812 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CTPS1P17812 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CTPS1P17812 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CTPS1P17812 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
CTPS1P17812 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CTPS1P17812 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CTPS1P17812 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CTPS1P17812 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CTPS1P17812 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CTPS1P17812 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CTPS1P17812 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CTPS1P17812 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CTPS1P17812 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CTPS1P17812 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CTPS1P17812 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CTPS1P17812 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CTPS1P17812 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CTPS1P17812 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CTPS1P17812 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CTPS1P17812 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CTPS1P17812 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CTPS1P17812 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CTPS1P17812 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTPS1P17812 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTPS1P17812 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTPS1P17812 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTPS1P17812 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTPS1P17812 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTPS1P17812 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTPS1P17812 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTPS1P17812 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTPS1P17812 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTPS1P17812 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTPS1P17812 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CTPS1P17812 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTPS1P17812 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CTPS1P17812 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CTPS1P17812 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTPS1P17812 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTPS1P17812 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTPS1P17812 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTPS1P17812 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTPS1P17812 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTPS1P17812 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTPS1P17812 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTPS1P17812 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTPS1P17812 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTPS1P17812 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTPS1P17812 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTPS1P17812 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTPS1P17812 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTPS1P17812 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTPS1P17812 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTPS1P17812 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTPS1P17812 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTPS1P17812 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTPS1P17812 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTPS1P17812 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTPS1P17812 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTPS1P17812 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTPS1P17812 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTPS1P17812 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CTPS1P17812 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTPS1P17812 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTPS1P17812 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTPS1P17812 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTPS1P17812 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTPS1P17812 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTPS1P17812 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTPS1P17812 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTPS1P17812 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTPS1P17812 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTPS1P17812 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms