Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXB9P17482 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXB9P17482 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXB9P17482 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXB9P17482 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXB9P17482 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXB9P17482 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXB9P17482 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXB9P17482 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXB9P17482 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXB9P17482 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXB9P17482 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXB9P17482 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXB9P17482 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXB9P17482 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXB9P17482 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXB9P17482 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXB9P17482 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXB9P17482 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXB9P17482 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXB9P17482 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXB9P17482 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXB9P17482 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXB9P17482 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXB9P17482 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXB9P17482 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXB9P17482 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXB9P17482 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXB9P17482 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXB9P17482 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXB9P17482 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXB9P17482 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXB9P17482 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXB9P17482 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXB9P17482 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXB9P17482 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXB9P17482 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXB9P17482 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXB9P17482 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXB9P17482 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXB9P17482 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXB9P17482 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXB9P17482 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXB9P17482 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXB9P17482 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXB9P17482 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXB9P17482 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXB9P17482 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXB9P17482 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXB9P17482 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXB9P17482 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXB9P17482 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXB9P17482 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXB9P17482 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXB9P17482 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXB9P17482 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXB9P17482 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXB9P17482 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXB9P17482 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXB9P17482 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXB9P17482 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXB9P17482 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXB9P17482 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXB9P17482 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXB9P17482 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXB9P17482 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXB9P17482 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXB9P17482 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXB9P17482 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXB9P17482 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXB9P17482 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXB9P17482 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXB9P17482 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXB9P17482 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXB9P17482 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXB9P17482 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXB9P17482 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXB9P17482 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXB9P17482 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXB9P17482 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXB9P17482 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXB9P17482 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXB9P17482 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXB9P17482 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXB9P17482 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXB9P17482 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXB9P17482 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXB9P17482 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXB9P17482 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXB9P17482 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXB9P17482 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXB9P17482 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXB9P17482 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXB9P17482 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXB9P17482 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXB9P17482 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXB9P17482 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXB9P17482 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXB9P17482 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXB9P17482 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms