Protein–RNA interactions for Protein: P16619

CCL3L1, C-C motif chemokine 3-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L1P16619 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms