Protein–RNA interactions for Protein: P13569

CFTR, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, humanhuman

Predictions only

Length 1,480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFTRP13569 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
CFTRP13569 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
CFTRP13569 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
CFTRP13569 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
CFTRP13569 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
CFTRP13569 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
CFTRP13569 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
CFTRP13569 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
CFTRP13569 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
CFTRP13569 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
CFTRP13569 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
CFTRP13569 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
CFTRP13569 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
CFTRP13569 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
CFTRP13569 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
CFTRP13569 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
CFTRP13569 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
CFTRP13569 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
CFTRP13569 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC33.52■■■□□ 2.96
CFTRP13569 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
CFTRP13569 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
CFTRP13569 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
CFTRP13569 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
CFTRP13569 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
CFTRP13569 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
CFTRP13569 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
CFTRP13569 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
CFTRP13569 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
CFTRP13569 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
CFTRP13569 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
CFTRP13569 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
CFTRP13569 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.96
CFTRP13569 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
CFTRP13569 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
CFTRP13569 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
CFTRP13569 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
CFTRP13569 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
CFTRP13569 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
CFTRP13569 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
CFTRP13569 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
CFTRP13569 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
CFTRP13569 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
CFTRP13569 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
CFTRP13569 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
CFTRP13569 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
CFTRP13569 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
CFTRP13569 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
CFTRP13569 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
CFTRP13569 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
CFTRP13569 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
CFTRP13569 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
CFTRP13569 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
CFTRP13569 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
CFTRP13569 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
CFTRP13569 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CFTRP13569 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
CFTRP13569 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CFTRP13569 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
CFTRP13569 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC33.48■■■□□ 2.95
CFTRP13569 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.48■■■□□ 2.95
CFTRP13569 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC33.48■■■□□ 2.95
CFTRP13569 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CFTRP13569 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CFTRP13569 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
CFTRP13569 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
CFTRP13569 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
CFTRP13569 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
CFTRP13569 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
CFTRP13569 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
CFTRP13569 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
CFTRP13569 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
CFTRP13569 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
CFTRP13569 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
CFTRP13569 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
CFTRP13569 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
CFTRP13569 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
CFTRP13569 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
CFTRP13569 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
CFTRP13569 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
CFTRP13569 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
CFTRP13569 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
CFTRP13569 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
CFTRP13569 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
CFTRP13569 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
CFTRP13569 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
CFTRP13569 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
CFTRP13569 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
CFTRP13569 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
CFTRP13569 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
CFTRP13569 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
CFTRP13569 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
CFTRP13569 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
CFTRP13569 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
CFTRP13569 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
CFTRP13569 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.95
CFTRP13569 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
CFTRP13569 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.95
CFTRP13569 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
CFTRP13569 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
CFTRP13569 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms