Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXD8P13378 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXD8P13378 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXD8P13378 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXD8P13378 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXD8P13378 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXD8P13378 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXD8P13378 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXD8P13378 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXD8P13378 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXD8P13378 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXD8P13378 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXD8P13378 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXD8P13378 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXD8P13378 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXD8P13378 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXD8P13378 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXD8P13378 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXD8P13378 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXD8P13378 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXD8P13378 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXD8P13378 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXD8P13378 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXD8P13378 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXD8P13378 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXD8P13378 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXD8P13378 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXD8P13378 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXD8P13378 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXD8P13378 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
HOXD8P13378 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
HOXD8P13378 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXD8P13378 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXD8P13378 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXD8P13378 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXD8P13378 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXD8P13378 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXD8P13378 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXD8P13378 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXD8P13378 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXD8P13378 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXD8P13378 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXD8P13378 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXD8P13378 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXD8P13378 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXD8P13378 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXD8P13378 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXD8P13378 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXD8P13378 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXD8P13378 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXD8P13378 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXD8P13378 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXD8P13378 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXD8P13378 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXD8P13378 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXD8P13378 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXD8P13378 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXD8P13378 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXD8P13378 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXD8P13378 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXD8P13378 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXD8P13378 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXD8P13378 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXD8P13378 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXD8P13378 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXD8P13378 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXD8P13378 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXD8P13378 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXD8P13378 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXD8P13378 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXD8P13378 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXD8P13378 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXD8P13378 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXD8P13378 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXD8P13378 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXD8P13378 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXD8P13378 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXD8P13378 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXD8P13378 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXD8P13378 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXD8P13378 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXD8P13378 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXD8P13378 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXD8P13378 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXD8P13378 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXD8P13378 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXD8P13378 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXD8P13378 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXD8P13378 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXD8P13378 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXD8P13378 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXD8P13378 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXD8P13378 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXD8P13378 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXD8P13378 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXD8P13378 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXD8P13378 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXD8P13378 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXD8P13378 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXD8P13378 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
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