Protein–RNA interactions for Protein: P09327

VIL1, Villin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIL1P09327 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VIL1P09327 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VIL1P09327 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VIL1P09327 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VIL1P09327 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VIL1P09327 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VIL1P09327 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VIL1P09327 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VIL1P09327 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VIL1P09327 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VIL1P09327 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VIL1P09327 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VIL1P09327 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VIL1P09327 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VIL1P09327 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VIL1P09327 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VIL1P09327 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VIL1P09327 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VIL1P09327 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VIL1P09327 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VIL1P09327 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VIL1P09327 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VIL1P09327 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VIL1P09327 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VIL1P09327 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VIL1P09327 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VIL1P09327 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VIL1P09327 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VIL1P09327 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VIL1P09327 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VIL1P09327 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VIL1P09327 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VIL1P09327 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VIL1P09327 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VIL1P09327 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VIL1P09327 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VIL1P09327 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
VIL1P09327 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VIL1P09327 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VIL1P09327 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VIL1P09327 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VIL1P09327 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VIL1P09327 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
VIL1P09327 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VIL1P09327 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VIL1P09327 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VIL1P09327 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VIL1P09327 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VIL1P09327 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VIL1P09327 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VIL1P09327 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VIL1P09327 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VIL1P09327 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VIL1P09327 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VIL1P09327 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
VIL1P09327 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
VIL1P09327 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VIL1P09327 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
VIL1P09327 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VIL1P09327 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VIL1P09327 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
VIL1P09327 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
VIL1P09327 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
VIL1P09327 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VIL1P09327 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VIL1P09327 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VIL1P09327 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
VIL1P09327 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VIL1P09327 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VIL1P09327 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VIL1P09327 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VIL1P09327 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
VIL1P09327 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VIL1P09327 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
VIL1P09327 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VIL1P09327 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VIL1P09327 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VIL1P09327 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VIL1P09327 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VIL1P09327 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VIL1P09327 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VIL1P09327 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
VIL1P09327 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VIL1P09327 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
VIL1P09327 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VIL1P09327 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
VIL1P09327 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VIL1P09327 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VIL1P09327 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VIL1P09327 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VIL1P09327 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VIL1P09327 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VIL1P09327 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VIL1P09327 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VIL1P09327 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VIL1P09327 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VIL1P09327 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VIL1P09327 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VIL1P09327 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VIL1P09327 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms