Protein–RNA interactions for Protein: O60248

SOX15, Protein SOX-15, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX15O60248 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SOX15O60248 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SOX15O60248 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SOX15O60248 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SOX15O60248 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SOX15O60248 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SOX15O60248 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SOX15O60248 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SOX15O60248 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SOX15O60248 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SOX15O60248 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX15O60248 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX15O60248 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX15O60248 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX15O60248 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX15O60248 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX15O60248 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX15O60248 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX15O60248 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX15O60248 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX15O60248 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX15O60248 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX15O60248 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX15O60248 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX15O60248 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX15O60248 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX15O60248 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX15O60248 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX15O60248 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX15O60248 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX15O60248 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX15O60248 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX15O60248 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX15O60248 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX15O60248 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX15O60248 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX15O60248 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX15O60248 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX15O60248 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX15O60248 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX15O60248 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX15O60248 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOX15O60248 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOX15O60248 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOX15O60248 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOX15O60248 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOX15O60248 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOX15O60248 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOX15O60248 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SOX15O60248 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOX15O60248 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOX15O60248 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOX15O60248 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOX15O60248 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOX15O60248 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOX15O60248 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOX15O60248 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOX15O60248 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SOX15O60248 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOX15O60248 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOX15O60248 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOX15O60248 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOX15O60248 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOX15O60248 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOX15O60248 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOX15O60248 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOX15O60248 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOX15O60248 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOX15O60248 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOX15O60248 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOX15O60248 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOX15O60248 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOX15O60248 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOX15O60248 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOX15O60248 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOX15O60248 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOX15O60248 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOX15O60248 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOX15O60248 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOX15O60248 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOX15O60248 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SOX15O60248 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SOX15O60248 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SOX15O60248 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SOX15O60248 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SOX15O60248 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SOX15O60248 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SOX15O60248 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SOX15O60248 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SOX15O60248 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SOX15O60248 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SOX15O60248 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SOX15O60248 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SOX15O60248 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SOX15O60248 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SOX15O60248 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SOX15O60248 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SOX15O60248 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SOX15O60248 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SOX15O60248 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.5 ms