Protein–RNA interactions for Protein: O43711

TLX3, T-cell leukemia homeobox protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLX3O43711 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TLX3O43711 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TLX3O43711 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TLX3O43711 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TLX3O43711 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TLX3O43711 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TLX3O43711 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TLX3O43711 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TLX3O43711 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TLX3O43711 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TLX3O43711 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TLX3O43711 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TLX3O43711 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TLX3O43711 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TLX3O43711 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TLX3O43711 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TLX3O43711 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TLX3O43711 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TLX3O43711 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TLX3O43711 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TLX3O43711 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TLX3O43711 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TLX3O43711 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TLX3O43711 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TLX3O43711 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TLX3O43711 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TLX3O43711 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TLX3O43711 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TLX3O43711 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TLX3O43711 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TLX3O43711 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TLX3O43711 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TLX3O43711 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TLX3O43711 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TLX3O43711 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TLX3O43711 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TLX3O43711 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TLX3O43711 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TLX3O43711 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TLX3O43711 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TLX3O43711 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TLX3O43711 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TLX3O43711 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TLX3O43711 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TLX3O43711 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TLX3O43711 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TLX3O43711 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TLX3O43711 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TLX3O43711 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TLX3O43711 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TLX3O43711 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TLX3O43711 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TLX3O43711 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TLX3O43711 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TLX3O43711 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TLX3O43711 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TLX3O43711 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TLX3O43711 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TLX3O43711 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TLX3O43711 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TLX3O43711 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TLX3O43711 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TLX3O43711 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TLX3O43711 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TLX3O43711 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TLX3O43711 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TLX3O43711 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TLX3O43711 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TLX3O43711 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TLX3O43711 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TLX3O43711 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TLX3O43711 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TLX3O43711 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TLX3O43711 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TLX3O43711 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TLX3O43711 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TLX3O43711 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TLX3O43711 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TLX3O43711 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TLX3O43711 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TLX3O43711 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TLX3O43711 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TLX3O43711 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TLX3O43711 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TLX3O43711 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TLX3O43711 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TLX3O43711 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TLX3O43711 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TLX3O43711 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TLX3O43711 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TLX3O43711 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TLX3O43711 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TLX3O43711 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TLX3O43711 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TLX3O43711 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TLX3O43711 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TLX3O43711 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TLX3O43711 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TLX3O43711 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TLX3O43711 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms