Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SYNMO15061 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SYNMO15061 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SYNMO15061 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
SYNMO15061 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SYNMO15061 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
SYNMO15061 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
SYNMO15061 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SYNMO15061 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SYNMO15061 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SYNMO15061 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SYNMO15061 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SYNMO15061 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SYNMO15061 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SYNMO15061 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
SYNMO15061 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SYNMO15061 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SYNMO15061 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SYNMO15061 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SYNMO15061 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SYNMO15061 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SYNMO15061 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SYNMO15061 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SYNMO15061 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SYNMO15061 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SYNMO15061 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
SYNMO15061 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SYNMO15061 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SYNMO15061 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SYNMO15061 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SYNMO15061 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SYNMO15061 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SYNMO15061 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SYNMO15061 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SYNMO15061 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SYNMO15061 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SYNMO15061 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SYNMO15061 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SYNMO15061 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SYNMO15061 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SYNMO15061 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SYNMO15061 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SYNMO15061 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SYNMO15061 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SYNMO15061 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SYNMO15061 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SYNMO15061 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SYNMO15061 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SYNMO15061 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SYNMO15061 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SYNMO15061 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SYNMO15061 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SYNMO15061 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
SYNMO15061 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SYNMO15061 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SYNMO15061 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
SYNMO15061 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
SYNMO15061 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SYNMO15061 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SYNMO15061 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SYNMO15061 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SYNMO15061 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SYNMO15061 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SYNMO15061 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SYNMO15061 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SYNMO15061 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SYNMO15061 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SYNMO15061 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SYNMO15061 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SYNMO15061 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SYNMO15061 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
SYNMO15061 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SYNMO15061 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SYNMO15061 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SYNMO15061 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SYNMO15061 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SYNMO15061 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SYNMO15061 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SYNMO15061 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SYNMO15061 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SYNMO15061 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SYNMO15061 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SYNMO15061 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SYNMO15061 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SYNMO15061 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SYNMO15061 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SYNMO15061 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SYNMO15061 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SYNMO15061 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
SYNMO15061 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SYNMO15061 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SYNMO15061 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SYNMO15061 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SYNMO15061 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SYNMO15061 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SYNMO15061 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SYNMO15061 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
SYNMO15061 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SYNMO15061 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SYNMO15061 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms