Protein–RNA interactions for Protein: O14529

CUX2, Homeobox protein cut-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUX2O14529 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
CUX2O14529 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
CUX2O14529 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
CUX2O14529 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
CUX2O14529 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
CUX2O14529 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
CUX2O14529 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC33.46■■■□□ 2.95
CUX2O14529 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
CUX2O14529 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
CUX2O14529 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
CUX2O14529 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
CUX2O14529 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
CUX2O14529 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
CUX2O14529 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
CUX2O14529 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
CUX2O14529 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
CUX2O14529 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
CUX2O14529 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
CUX2O14529 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
CUX2O14529 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
CUX2O14529 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
CUX2O14529 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.94
CUX2O14529 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
CUX2O14529 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
CUX2O14529 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
CUX2O14529 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
CUX2O14529 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
CUX2O14529 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
CUX2O14529 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
CUX2O14529 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
CUX2O14529 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
CUX2O14529 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
CUX2O14529 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
CUX2O14529 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
CUX2O14529 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
CUX2O14529 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
CUX2O14529 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
CUX2O14529 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
CUX2O14529 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
CUX2O14529 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
CUX2O14529 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
CUX2O14529 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CUX2O14529 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CUX2O14529 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CUX2O14529 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CUX2O14529 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
CUX2O14529 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CUX2O14529 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
CUX2O14529 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC33.42■■■□□ 2.94
CUX2O14529 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CUX2O14529 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CUX2O14529 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CUX2O14529 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CUX2O14529 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CUX2O14529 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
CUX2O14529 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CUX2O14529 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CUX2O14529 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
CUX2O14529 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
CUX2O14529 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC33.42■■■□□ 2.94
CUX2O14529 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
CUX2O14529 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
CUX2O14529 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CUX2O14529 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CUX2O14529 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
CUX2O14529 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC33.41■■■□□ 2.94
CUX2O14529 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
CUX2O14529 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
CUX2O14529 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC33.41■■■□□ 2.94
CUX2O14529 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
CUX2O14529 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
CUX2O14529 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
CUX2O14529 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
CUX2O14529 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
CUX2O14529 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
CUX2O14529 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
CUX2O14529 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
CUX2O14529 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CUX2O14529 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
CUX2O14529 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
CUX2O14529 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CUX2O14529 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CUX2O14529 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
CUX2O14529 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
CUX2O14529 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
CUX2O14529 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
CUX2O14529 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
CUX2O14529 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
CUX2O14529 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
CUX2O14529 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
CUX2O14529 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
CUX2O14529 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
CUX2O14529 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
CUX2O14529 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
CUX2O14529 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
CUX2O14529 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.93
CUX2O14529 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
CUX2O14529 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
CUX2O14529 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
CUX2O14529 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms