Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SOBPA7XYQ1 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SOBPA7XYQ1 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SOBPA7XYQ1 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SOBPA7XYQ1 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SOBPA7XYQ1 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SOBPA7XYQ1 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SOBPA7XYQ1 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SOBPA7XYQ1 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SOBPA7XYQ1 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SOBPA7XYQ1 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SOBPA7XYQ1 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SOBPA7XYQ1 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SOBPA7XYQ1 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SOBPA7XYQ1 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SOBPA7XYQ1 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SOBPA7XYQ1 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SOBPA7XYQ1 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SOBPA7XYQ1 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SOBPA7XYQ1 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SOBPA7XYQ1 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SOBPA7XYQ1 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SOBPA7XYQ1 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SOBPA7XYQ1 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SOBPA7XYQ1 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SOBPA7XYQ1 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SOBPA7XYQ1 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SOBPA7XYQ1 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SOBPA7XYQ1 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SOBPA7XYQ1 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SOBPA7XYQ1 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SOBPA7XYQ1 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SOBPA7XYQ1 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SOBPA7XYQ1 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SOBPA7XYQ1 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SOBPA7XYQ1 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SOBPA7XYQ1 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SOBPA7XYQ1 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SOBPA7XYQ1 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SOBPA7XYQ1 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SOBPA7XYQ1 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SOBPA7XYQ1 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SOBPA7XYQ1 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SOBPA7XYQ1 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SOBPA7XYQ1 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SOBPA7XYQ1 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SOBPA7XYQ1 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SOBPA7XYQ1 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SOBPA7XYQ1 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SOBPA7XYQ1 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SOBPA7XYQ1 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SOBPA7XYQ1 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SOBPA7XYQ1 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SOBPA7XYQ1 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SOBPA7XYQ1 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SOBPA7XYQ1 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SOBPA7XYQ1 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SOBPA7XYQ1 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SOBPA7XYQ1 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SOBPA7XYQ1 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SOBPA7XYQ1 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SOBPA7XYQ1 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SOBPA7XYQ1 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SOBPA7XYQ1 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SOBPA7XYQ1 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SOBPA7XYQ1 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SOBPA7XYQ1 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SOBPA7XYQ1 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SOBPA7XYQ1 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SOBPA7XYQ1 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SOBPA7XYQ1 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SOBPA7XYQ1 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SOBPA7XYQ1 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SOBPA7XYQ1 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SOBPA7XYQ1 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SOBPA7XYQ1 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SOBPA7XYQ1 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SOBPA7XYQ1 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SOBPA7XYQ1 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SOBPA7XYQ1 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SOBPA7XYQ1 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SOBPA7XYQ1 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SOBPA7XYQ1 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SOBPA7XYQ1 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SOBPA7XYQ1 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SOBPA7XYQ1 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SOBPA7XYQ1 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SOBPA7XYQ1 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SOBPA7XYQ1 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SOBPA7XYQ1 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SOBPA7XYQ1 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SOBPA7XYQ1 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SOBPA7XYQ1 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SOBPA7XYQ1 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SOBPA7XYQ1 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SOBPA7XYQ1 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SOBPA7XYQ1 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SOBPA7XYQ1 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SOBPA7XYQ1 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SOBPA7XYQ1 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
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