Protein–RNA interactions for Protein: A2A3K4

PTPDC1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPDC1A2A3K4 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPDC1A2A3K4 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPDC1A2A3K4 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPDC1A2A3K4 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPDC1A2A3K4 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPDC1A2A3K4 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPDC1A2A3K4 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPDC1A2A3K4 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPDC1A2A3K4 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPDC1A2A3K4 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPDC1A2A3K4 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPDC1A2A3K4 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPDC1A2A3K4 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPDC1A2A3K4 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPDC1A2A3K4 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPDC1A2A3K4 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPDC1A2A3K4 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPDC1A2A3K4 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPDC1A2A3K4 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPDC1A2A3K4 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPDC1A2A3K4 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPDC1A2A3K4 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPDC1A2A3K4 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPDC1A2A3K4 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPDC1A2A3K4 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPDC1A2A3K4 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPDC1A2A3K4 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPDC1A2A3K4 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPDC1A2A3K4 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPDC1A2A3K4 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPDC1A2A3K4 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPDC1A2A3K4 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPDC1A2A3K4 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPDC1A2A3K4 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPDC1A2A3K4 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPDC1A2A3K4 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPDC1A2A3K4 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPDC1A2A3K4 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPDC1A2A3K4 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPDC1A2A3K4 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPDC1A2A3K4 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPDC1A2A3K4 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPDC1A2A3K4 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPDC1A2A3K4 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPDC1A2A3K4 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PTPDC1A2A3K4 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PTPDC1A2A3K4 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PTPDC1A2A3K4 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PTPDC1A2A3K4 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PTPDC1A2A3K4 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PTPDC1A2A3K4 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PTPDC1A2A3K4 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PTPDC1A2A3K4 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PTPDC1A2A3K4 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PTPDC1A2A3K4 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PTPDC1A2A3K4 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPDC1A2A3K4 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPDC1A2A3K4 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPDC1A2A3K4 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPDC1A2A3K4 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPDC1A2A3K4 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPDC1A2A3K4 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPDC1A2A3K4 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPDC1A2A3K4 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPDC1A2A3K4 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPDC1A2A3K4 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPDC1A2A3K4 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPDC1A2A3K4 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPDC1A2A3K4 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPDC1A2A3K4 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPDC1A2A3K4 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPDC1A2A3K4 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPDC1A2A3K4 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPDC1A2A3K4 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPDC1A2A3K4 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPDC1A2A3K4 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPDC1A2A3K4 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPDC1A2A3K4 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPDC1A2A3K4 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPDC1A2A3K4 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPDC1A2A3K4 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPDC1A2A3K4 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPDC1A2A3K4 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPDC1A2A3K4 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPDC1A2A3K4 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPDC1A2A3K4 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPDC1A2A3K4 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPDC1A2A3K4 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPDC1A2A3K4 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPDC1A2A3K4 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPDC1A2A3K4 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPDC1A2A3K4 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPDC1A2A3K4 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPDC1A2A3K4 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPDC1A2A3K4 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPDC1A2A3K4 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPDC1A2A3K4 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPDC1A2A3K4 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPDC1A2A3K4 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPDC1A2A3K4 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms