Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WWV3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A087WWV3 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A087WWV3 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A087WWV3 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A087WWV3 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A087WWV3 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A087WWV3 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A087WWV3 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A087WWV3 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A087WWV3 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A087WWV3 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A087WWV3 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A087WWV3 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A087WWV3 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A087WWV3 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A087WWV3 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A087WWV3 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A087WWV3 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
A0A087WWV3 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
A0A087WWV3 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A087WWV3 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A087WWV3 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A087WWV3 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A087WWV3 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A087WWV3 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A087WWV3 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A087WWV3 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A087WWV3 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A087WWV3 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A087WWV3 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A087WWV3 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A087WWV3 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A087WWV3 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A087WWV3 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A087WWV3 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A087WWV3 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A087WWV3 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A087WWV3 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A087WWV3 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A087WWV3 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A087WWV3 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A087WWV3 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A087WWV3 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A087WWV3 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A087WWV3 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A087WWV3 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A087WWV3 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A087WWV3 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A087WWV3 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A087WWV3 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A087WWV3 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A087WWV3 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A087WWV3 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A087WWV3 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A087WWV3 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A087WWV3 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A087WWV3 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A087WWV3 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A087WWV3 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A087WWV3 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A087WWV3 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A087WWV3 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A087WWV3 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A087WWV3 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A087WWV3 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A087WWV3 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A087WWV3 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A087WWV3 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A087WWV3 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A087WWV3 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A087WWV3 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A087WWV3 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A087WWV3 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A087WWV3 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A087WWV3 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A087WWV3 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A087WWV3 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A087WWV3 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A087WWV3 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A087WWV3 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A087WWV3 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A087WWV3 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A087WWV3 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A087WWV3 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A087WWV3 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A087WWV3 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A087WWV3 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A087WWV3 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A087WWV3 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A087WWV3 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A087WWV3 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A087WWV3 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A087WWV3 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A087WWV3 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A087WWV3 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A087WWV3 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A087WWV3 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A087WWV3 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A087WWV3 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A087WWV3 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A087WWV3 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms