Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 MTND1P32-201ENST00000433043 938 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 AL355357.1-201ENST00000433531 417 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 MTCO1P52-201ENST00000433928 531 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 AC022537.1-201ENST00000435271 446 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 AC002542.1-201ENST00000440683 193 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 AC118469.1-201ENST00000442943 488 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 MTND2P4-201ENST00000445034 1004 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 AC099342.1-201ENST00000446399 1124 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 AC104781.1-201ENST00000449838 397 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 ATP5A1P7-201ENST00000453978 1279 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 ANKRD26P4-201ENST00000455755 950 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 RN7SL172P-201ENST00000460535 303 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 AC093267.1-201ENST00000489176 961 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 AC080013.1-206ENST00000496842 712 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 EGFLAM-AS3-201ENST00000505267 549 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 AC079921.1-201ENST00000509449 946 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 AC097515.1-201ENST00000512370 435 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 LINC02500-201ENST00000512547 493 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 AC098829.1-202ENST00000513384 537 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 NDUFB4P12-201ENST00000513465 390 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 MTHFD2P4-201ENST00000515074 1025 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 C1GALT1P3-201ENST00000522049 819 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 AL078612.2-201ENST00000525133 646 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 AP003080.1-202ENST00000526526 915 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 NR1H4-204ENST00000546380 565 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 AC011773.3-201ENST00000546501 589 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 AC034102.2-201ENST00000548861 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 CR383656.6-201ENST00000550518 394 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 AC084824.1-201ENST00000550917 1005 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 NBEAP1-201ENST00000554452 979 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 WDR61-205ENST00000558459 884 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 AC113208.4-201ENST00000563568 206 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 AC009019.1-202ENST00000568410 405 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 AC092132.1-201ENST00000570859 352 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 AC103808.1-201ENST00000579833 922 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 AC015845.2-201ENST00000581805 472 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 AC023394.2-201ENST00000581987 792 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 TTN-AS1-217ENST00000585625 945 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 LINC01081-201ENST00000597373 465 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 VN1R74P-201ENST00000613259 503 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 RN7SL544P-201ENST00000617232 284 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 RN7SL763P-201ENST00000620922 284 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 CU639417.4-201ENST00000623928 207 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 CGA-204ENST00000627148 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 GOLT1B-210ENST00000631252 223 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 SRGAP1-201ENST00000355086 23331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 LINC02019-201ENST00000608605 2060 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 ANO4-202ENST00000392979 3909 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 LINC01206-204ENST00000482787 9580 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 CHMP1B2P-202ENST00000614414 6813 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 PSMD6-202ENST00000394431 1349 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 MTM1-203ENST00000370396 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
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USP18Q9UMW8 URI1-201ENST00000360605 1579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 RNF20-202ENST00000389120 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 NELL2-201ENST00000333837 2943 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 ADAM29-202ENST00000404450 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 PIAS2-204ENST00000585916 11075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 ADAMDEC1-201ENST00000256412 2348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 SYCP1-201ENST00000369518 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 ZNF260-204ENST00000592282 5055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 MRE11-203ENST00000393241 2604 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 IL21-201ENST00000264497 629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
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USP18Q9UMW8 OR5T3-202ENST00000313033 969 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 AC008549.2-201ENST00000333482 706 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 OR6C3-201ENST00000379667 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 SNORA56-201ENST00000383966 129 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 TRAJ58-201ENST00000390481 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 AC005042.1-201ENST00000393397 800 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 RNF10P1-201ENST00000418589 369 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 BX470102.1-201ENST00000420695 531 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 LINC01740-201ENST00000423842 332 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 AL356056.1-206ENST00000424615 407 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 NAALADL2-AS1-201ENST00000426315 804 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 MIR4435-2HG-206ENST00000432818 572 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 TMEM244-202ENST00000438392 565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 AL353093.1-201ENST00000441292 436 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 RPS23P9-201ENST00000448848 438 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 RPL7AP6-201ENST00000477943 801 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 AC022215.1-201ENST00000481770 362 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 RPSAP50-201ENST00000481955 852 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 AL139147.1-201ENST00000502413 1156 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 MND1-203ENST00000504860 638 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 AC097512.1-203ENST00000506425 957 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 GLUD1P3-202ENST00000508551 200 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 AC034238.3-201ENST00000512349 591 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 LINC01030-201ENST00000517505 738 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 AC068413.1-201ENST00000517739 776 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 AF117829.1-208ENST00000521996 915 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 MAL2-207ENST00000522828 603 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 OR8Q1P-201ENST00000526467 655 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 AP003306.1-201ENST00000529875 353 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 AP002370.2-202ENST00000533669 908 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 AC008126.1-201ENST00000549019 480 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 AL136501.1-201ENST00000555913 790 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 PDE6G-203ENST00000571224 526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 MTCO1P40-201ENST00000574371 625 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 AC004448.4-204ENST00000585389 743 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 AC008764.2-201ENST00000597226 376 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
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