Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 METTL9-211ENST00000615720 2890 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
FXNQ16595 ZEB2-AS1-202ENST00000427278 1322 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
FXNQ16595 AL162726.3-201ENST00000637606 1301 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
FXNQ16595 NEDD9-202ENST00000379446 4536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
FXNQ16595 GUCY1B2-204ENST00000531898 1979 ntBASIC6□□□□□ -1.45
FXNQ16595 DNM1P47-202ENST00000561463 15043 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
FXNQ16595 HPGDS-201ENST00000295256 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
FXNQ16595 SOAT1-201ENST00000367619 6835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
FXNQ16595 AC092447.7-201ENST00000422212 1621 ntBASIC6□□□□□ -1.45
FXNQ16595 DCN-218ENST00000551354 2924 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
FXNQ16595 CASC15-207ENST00000607048 1634 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
FXNQ16595 NCOA7-208ENST00000438495 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
FXNQ16595 CHD2-215ENST00000628375 3202 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
FXNQ16595 NLGN1-202ENST00000401917 1827 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
FXNQ16595 ALS2CR12-202ENST00000392257 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
FXNQ16595 TESPA1-212ENST00000532804 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
FXNQ16595 C8orf59-201ENST00000321777 325 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
FXNQ16595 FAS-203ENST00000355279 983 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
FXNQ16595 RPS24-201ENST00000360830 514 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
FXNQ16595 Y_RNA.6-201ENST00000362350 114 ntBASIC6□□□□□ -1.45
FXNQ16595 RNU6-657P-201ENST00000383904 107 ntBASIC6□□□□□ -1.45
FXNQ16595 Y_RNA.516-201ENST00000384541 124 ntBASIC6□□□□□ -1.45
FXNQ16595 MIR187-201ENST00000385062 109 ntBASIC6□□□□□ -1.45
FXNQ16595 MTCYBP36-201ENST00000404146 440 ntBASIC6□□□□□ -1.45
FXNQ16595 AC107079.1-201ENST00000416509 669 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
FXNQ16595 AL358394.1-201ENST00000422807 535 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
FXNQ16595 AC092651.1-201ENST00000426110 312 ntBASIC6□□□□□ -1.45
FXNQ16595 AL512649.1-201ENST00000428997 581 ntBASIC6□□□□□ -1.45
FXNQ16595 AL451070.1-201ENST00000430143 439 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
FXNQ16595 OR2B8P-201ENST00000432841 938 ntBASIC6□□□□□ -1.45
FXNQ16595 FMO7P-201ENST00000436045 768 ntBASIC6□□□□□ -1.45
FXNQ16595 LINC02013-201ENST00000438156 526 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
FXNQ16595 AL451164.3-201ENST00000441377 447 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
FXNQ16595 SNRPBP1-201ENST00000443634 282 ntBASIC6□□□□□ -1.45
FXNQ16595 UBBP5-201ENST00000446970 266 ntBASIC6□□□□□ -1.45
FXNQ16595 AC243772.1-201ENST00000451620 410 ntBASIC6□□□□□ -1.45
FXNQ16595 HMGN3P1-201ENST00000453847 193 ntBASIC6□□□□□ -1.45
FXNQ16595 RN7SL188P-201ENST00000469842 285 ntBASIC6□□□□□ -1.45
FXNQ16595 AC010655.2-201ENST00000493710 662 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
FXNQ16595 AL136537.1-202ENST00000501725 430 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
FXNQ16595 AC139491.5-201ENST00000510029 920 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
FXNQ16595 AC026785.3-201ENST00000511182 285 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
FXNQ16595 AC108727.2-201ENST00000512277 392 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
FXNQ16595 HAND2-AS1-233ENST00000515345 797 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
FXNQ16595 RN7SKP96-201ENST00000516948 297 ntBASIC6□□□□□ -1.45
FXNQ16595 AC110011.1-201ENST00000518260 582 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
FXNQ16595 TIMM9-209ENST00000556367 572 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
FXNQ16595 AC037479.1-201ENST00000558361 625 ntBASIC6□□□□□ -1.45
FXNQ16595 LYRM1-208ENST00000567954 460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
FXNQ16595 TMEM87A-212ENST00000568432 750 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
FXNQ16595 RN7SL208P-201ENST00000577964 296 ntBASIC6□□□□□ -1.45
FXNQ16595 AC091691.2-201ENST00000581940 567 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
FXNQ16595 AL157938.2-201ENST00000587264 894 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
FXNQ16595 AC004542.1-201ENST00000602955 264 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
FXNQ16595 AC005084.1-201ENST00000605160 304 ntBASIC6□□□□□ -1.45
FXNQ16595 NDUFA8P1-201ENST00000605525 367 ntBASIC6□□□□□ -1.45
FXNQ16595 AC090186.1-201ENST00000605991 572 ntBASIC6□□□□□ -1.45
FXNQ16595 TEX41-254ENST00000626394 423 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
FXNQ16595 SLC38A9-203ENST00000416547 2236 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
FXNQ16595 MUC5B-204ENST00000529681 17911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
FXNQ16595 AL031985.3-201ENST00000565390 2449 ntBASIC6□□□□□ -1.45
FXNQ16595 FOXJ3-204ENST00000372572 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
FXNQ16595 CFHR3-206ENST00000617219 1462 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
FXNQ16595 SLC1A2-202ENST00000395750 11538 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
FXNQ16595 TC2N-203ENST00000435962 5146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
FXNQ16595 AC007557.3-201ENST00000418591 3135 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
FXNQ16595 PLS3-201ENST00000289290 2277 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
FXNQ16595 MAPK10-370ENST00000641943 4117 ntAPPRIS P2 BASIC6□□□□□ -1.45
FXNQ16595 FHL1-218ENST00000543669 2878 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
FXNQ16595 CAMSAP2-201ENST00000236925 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
FXNQ16595 RMST-209ENST00000639542 3269 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
FXNQ16595 USP7-202ENST00000381886 3587 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
FXNQ16595 TIMM9-202ENST00000395159 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
FXNQ16595 AL513550.1-201ENST00000418945 1638 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
FXNQ16595 SP110-204ENST00000392048 1937 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
FXNQ16595 BACH1-202ENST00000399921 5769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
FXNQ16595 UBR5-204ENST00000518205 1931 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
FXNQ16595 PKIA-AS1-202ENST00000522302 2011 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
FXNQ16595 C9-201ENST00000263408 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
FXNQ16595 ZNF329-203ENST00000597186 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
FXNQ16595 LEPROT-206ENST00000613538 4625 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
FXNQ16595 TOP2B-201ENST00000264331 5358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
FXNQ16595 KMO-203ENST00000366558 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
FXNQ16595 AC093775.1-201ENST00000624154 1868 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
FXNQ16595 DDHD2-202ENST00000517385 4113 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
FXNQ16595 OR2M4-201ENST00000306687 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
FXNQ16595 Y_RNA.41-201ENST00000362646 102 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
FXNQ16595 RNU6-462P-201ENST00000362659 105 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
FXNQ16595 RNU6-1042P-201ENST00000384204 107 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
FXNQ16595 TOMM6-202ENST00000398884 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
FXNQ16595 C1GALT1-202ENST00000402468 930 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
FXNQ16595 FCF1P9-201ENST00000412546 282 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
FXNQ16595 RPL21P108-201ENST00000413857 481 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
FXNQ16595 AL162254.1-202ENST00000419604 497 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
FXNQ16595 LINC01794-201ENST00000420187 549 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
FXNQ16595 AL139184.1-202ENST00000422303 222 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
FXNQ16595 AC024619.1-202ENST00000426489 495 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
FXNQ16595 AL354707.3-201ENST00000427308 331 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
FXNQ16595 NPM1P24-201ENST00000428039 894 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
FXNQ16595 AL138733.2-201ENST00000431947 804 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
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