Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 EIF4A2P5-201ENST00000529914 499 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 AL121594.2-201ENST00000541658 472 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 AC090502.3-201ENST00000552046 529 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 LINC01467-201ENST00000554211 1187 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 LINC01908-201ENST00000583148 555 ntTSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 AC119403.2-201ENST00000590960 598 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 AC007193.1-201ENST00000599645 448 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 SATB1-AS1-222ENST00000600177 751 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 NTAN1P1-201ENST00000603150 646 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 AL390816.3-201ENST00000604527 1066 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 AC092681.3-201ENST00000609463 678 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 uc_338.26-201ENST00000612659 160 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 AP001962.1-201ENST00000624114 559 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 AC007494.3-201ENST00000624660 743 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 LINC01955-201ENST00000626392 792 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 LARP7-210ENST00000509061 2332 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 LINC02010-202ENST00000471638 1829 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 SPAM1-203ENST00000402183 1860 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 TNFAIP8-207ENST00000513374 1385 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 LINC01923-203ENST00000456248 2528 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 ESF1-201ENST00000202816 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 ZBED6-202ENST00000550078 12481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 GTF2IRD2P1-202ENST00000618962 3055 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 ANKRD30A-204ENST00000602533 4458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 AC087359.1-201ENST00000508335 1740 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 AL603750.1-201ENST00000624216 1717 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 P2RY14-202ENST00000424796 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 ZNF431-201ENST00000311048 13894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 NRDE2-201ENST00000354366 14208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 OR8J2-201ENST00000641465 2883 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 DSE-204ENST00000452085 10586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 NAP1L4P1-201ENST00000319092 1157 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 RNASE9-201ENST00000338904 1049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 ODF3-202ENST00000342593 386 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 RNA5SP375-201ENST00000362975 119 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 USMG5-203ENST00000369811 635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 MLIP-203ENST00000370877 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 ZCCHC6-202ENST00000375947 611 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 AL161909.1-201ENST00000397390 712 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 RNA5SP156-201ENST00000410250 110 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 P2RY10P2-201ENST00000416730 913 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 MS4A6A-202ENST00000420732 863 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 AL451127.1-201ENST00000422909 624 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 PCBP2P1-201ENST00000437262 977 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 USP12-AS1-201ENST00000440657 268 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 AC016772.1-201ENST00000444170 1261 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 OR52E7P-201ENST00000452394 933 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 SDC4P-201ENST00000453285 601 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 AKR1C2-203ENST00000455190 1098 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 PNPLA4P1-201ENST00000458328 305 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 AL603882.1-201ENST00000463059 681 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 MTND1P16-201ENST00000465177 898 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 MDM2-217ENST00000478070 692 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 AC015724.1-201ENST00000478577 156 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 LINC02213-202ENST00000506021 774 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 LINC02465-201ENST00000507099 532 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 MTND5P13-201ENST00000513046 1079 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 AC093879.2-201ENST00000513645 427 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 AC092436.2-201ENST00000515188 411 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 AC099550.1-201ENST00000515495 871 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 RNU6-1225P-201ENST00000516336 65 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 AC090150.1-201ENST00000521408 585 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 COX6B1P6-201ENST00000522347 255 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 RSF1-IT2-201ENST00000529656 566 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 AL358913.1-201ENST00000554342 121 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 SRP54-AS1-203ENST00000556355 603 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 AC051619.4-201ENST00000560034 292 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 GTF2IP8-201ENST00000560687 584 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 ZNF971P-202ENST00000568619 461 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 AC015912.1-201ENST00000574826 538 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 ISCA1P3-201ENST00000577104 373 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 AC022211.1-201ENST00000579554 717 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 PPIAL4F-202ENST00000581138 660 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 PPIAL4E-201ENST00000581164 785 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 AC243756.1-201ENST00000584068 660 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 LINC01533-204ENST00000590719 435 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 RMDN2-AS1-203ENST00000601029 613 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 LINC01435-212ENST00000601212 742 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 AC010422.4-201ENST00000601420 533 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 AL137072.1-201ENST00000603444 466 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 AC008555.7-201ENST00000605008 583 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 ZRANB2-AS2-218ENST00000608360 722 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 AL080312.2-201ENST00000613001 630 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 AC005858.1-201ENST00000620193 677 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 LINC00969-332ENST00000630874 738 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 PTPRD-205ENST00000397611 8242 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 SLC10A5P1-201ENST00000379063 1306 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 ARHGEF38-201ENST00000265154 1437 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 AC087667.1-201ENST00000500180 1422 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 AC083843.2-201ENST00000568248 6253 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 GLRA2-202ENST00000355020 1730 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 AC073136.1-201ENST00000449426 2884 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 AC119744.1-201ENST00000454746 1715 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 METTL15-201ENST00000303459 4068 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 LINC01847-202ENST00000523311 1762 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 ARID2-202ENST00000422737 5481 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 DUSP19-202ENST00000354221 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 DIAPH3-208ENST00000498416 2249 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 LGI1-202ENST00000371418 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 TMEM68-209ENST00000521229 2400 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.4 ms