Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 NBPF12-206ENST00000617844 6326 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 PLCE1-201ENST00000371375 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 ZNF644-204ENST00000370440 5702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 MEF2C-226ENST00000625674 4343 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 POLR1A-201ENST00000263857 12749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 ARID4A-203ENST00000395168 4051 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 KALRN-204ENST00000360013 10806 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 SPARCL1-202ENST00000418378 2994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 FOXP1-212ENST00000491238 2250 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 SETDB2-201ENST00000258672 2138 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 AP005901.5-201ENST00000545779 1796 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 GYPA-214ENST00000641688 1764 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 AC100858.3-201ENST00000533516 1605 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 MR1-209ENST00000617803 7584 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 MTCO1P18-201ENST00000455518 1419 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 SAMM50P1-201ENST00000455403 1399 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 OR4K1-203ENST00000641429 1358 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 OR9G4-201ENST00000302957 984 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 EDDM3A-201ENST00000326842 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 TAF13-201ENST00000338366 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 ZBTB8OSP1-201ENST00000342688 498 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 MIR323B-201ENST00000385269 82 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 MT-TL1-201ENST00000386347 75 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 AC107079.1-201ENST00000416509 669 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 AL445989.1-202ENST00000418943 776 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 PLCE1-AS2-201ENST00000419353 459 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 RNGTTP1-201ENST00000420965 728 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 ARPC3P1-201ENST00000437218 533 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 ATP6V1E1P1-201ENST00000439215 681 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 AL354936.1-201ENST00000441521 649 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 KRTAP2-5P-201ENST00000446109 396 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 COX6CP12-201ENST00000446748 202 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 AC079760.2-201ENST00000449361 681 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 LINC01825-201ENST00000452381 850 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 AP001596.1-202ENST00000452460 644 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 VPS25P1-201ENST00000455691 508 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 LINC00430-201ENST00000457672 597 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 UCK2-205ENST00000469256 753 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 RPS3AP17-201ENST00000472594 777 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 MTND6P6-201ENST00000478031 263 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 NIPA2P2-201ENST00000496376 1083 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 AL358832.1-201ENST00000497800 389 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 SAR1B-204ENST00000502539 708 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 AC079467.1-201ENST00000508512 503 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 AC109445.1-201ENST00000512356 383 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 ARL2BPP6-201ENST00000512757 439 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 AC091185.1-201ENST00000523840 528 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 AC091047.1-201ENST00000533344 552 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 NANOGNBP2-201ENST00000544753 553 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 AC079905.1-201ENST00000549280 475 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 AC123567.2-202ENST00000550759 446 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 CYP2C60P-201ENST00000566088 139 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 AC091489.2-201ENST00000566263 604 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 AC024361.3-201ENST00000570919 333 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 MIR5095-201ENST00000578844 88 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 MIR3671-201ENST00000580455 88 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 CYCSP1-201ENST00000604815 315 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 AL008723.3-201ENST00000608926 449 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 AC055764.2-201ENST00000610089 670 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 AC131902.3-201ENST00000611767 581 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 AC002553.4-201ENST00000616896 331 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 ATXN3-251ENST00000617719 1074 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 OXSM-209ENST00000626005 309 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 AC024614.3-201ENST00000637860 256 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 COG2-209ENST00000534989 2963 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 OR10A6-203ENST00000641238 6052 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 PDE4D-226ENST00000546160 7690 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 RTN4-203ENST00000357376 4110 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 REST-201ENST00000309042 7300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 AC010127.1-209ENST00000447809 2305 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 TXNRD1-212ENST00000526390 3808 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 AKAP7-201ENST00000263050 2238 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 AC093849.1-201ENST00000563631 2209 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 PDE4D-228ENST00000636120 6659 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 CCDC158-201ENST00000388914 3663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 AC096921.2-201ENST00000561507 1916 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 ELOVL5-203ENST00000370918 3081 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 AC105235.1-201ENST00000623208 1816 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 CPED1-201ENST00000310396 5340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 SMIM21-203ENST00000584508 2554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 ABCA6-206ENST00000590645 1511 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 UGT2A2-201ENST00000604021 1544 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 CNTRL-204ENST00000373847 3372 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 CAMSAP2-201ENST00000236925 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 FAM216B-202ENST00000537894 3300 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 LSAMP-207ENST00000539563 8821 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 OR2A12-202ENST00000641592 4163 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 AL354854.1-201ENST00000455940 1363 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 SLF1-201ENST00000265140 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 PBRM1-207ENST00000409767 4849 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 OR1L1-201ENST00000309623 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 Y_RNA.9-201ENST00000362354 101 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 SNORA21-201ENST00000362423 132 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 PRKACB-203ENST00000370684 869 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 RNU5A-6P-201ENST00000384136 116 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 MIR640-201ENST00000385086 96 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 SNORD65-201ENST00000391079 73 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 SPRR2A-201ENST00000392653 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 AC093719.1-202ENST00000392735 373 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
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