Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 RNU6-316P-201ENST00000391027 107 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 GLS-204ENST00000409428 816 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 AC060834.2-201ENST00000447999 618 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 AC115837.2-201ENST00000522127 677 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 AP003730.1-201ENST00000524605 285 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 AC104241.1-201ENST00000530039 628 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 KLRC2-204ENST00000536833 771 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 AC002094.2-201ENST00000577850 1121 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 RNU4-89P-201ENST00000607443 133 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 MILR1-203ENST00000615220 1196 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 MIR6875-201ENST00000617506 72 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 TRIM77-201ENST00000398290 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 RDH10-AS1-201ENST00000514599 3261 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 ADAM7-201ENST00000175238 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 SLX4IP-201ENST00000334534 6062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 PLCB4-206ENST00000414679 3947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 KCNAB1-205ENST00000471742 3301 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 DDX4-204ENST00000505374 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 MTRNR2L7-201ENST00000544824 1535 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 CBX5-201ENST00000209875 11528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 ZNF285-204ENST00000591679 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 TMEM255A-202ENST00000371352 2879 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 RNA5SP124-201ENST00000362739 110 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 RN7SKP235-201ENST00000410662 305 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 GCA-203ENST00000429691 824 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 GOT2P5-201ENST00000433995 546 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 MRPS21P3-201ENST00000436696 262 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 AL935212.3-201ENST00000450729 284 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 AL391427.1-201ENST00000451575 425 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 SNORA67.7-201ENST00000516664 135 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 AP000827.1-201ENST00000527814 258 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 AC079907.2-202ENST00000547004 423 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 LINC01028-202ENST00000588782 458 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 C2orf91-203ENST00000615044 393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 AC005899.7-201ENST00000618199 588 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 LINC01808-202ENST00000641680 1116 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 AC090220.1-201ENST00000593078 1699 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 INPP4B-201ENST00000262992 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 PUS10-201ENST00000316752 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 ZNF266-207ENST00000592904 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 TRAT1-201ENST00000295756 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 MECOM-202ENST00000433243 3508 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 CCNB3-201ENST00000276014 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 CDC23-202ENST00000394886 3155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 DYTN-201ENST00000452335 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 MMRN1-202ENST00000394980 5217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 AL359922.3-201ENST00000624779 1670 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 PTPN13-209ENST00000511467 8076 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 RNA5SP151-201ENST00000365632 117 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 WFDC6-202ENST00000372670 620 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 BPY2-202ENST00000382585 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 AMZ2P2-201ENST00000406819 1057 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 AC093578.1-201ENST00000415219 368 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 MFSD13B-201ENST00000420133 1290 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 TTC3-AS1-201ENST00000424733 1097 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 AL157831.1-201ENST00000426134 473 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 LINC01921-201ENST00000456163 393 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 AC117430.1-201ENST00000474711 801 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 PLSCR5-202ENST00000482567 1018 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 AC087439.2-201ENST00000519498 552 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 TTN-AS1-217ENST00000585625 945 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 LINC00907-211ENST00000601948 795 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 BPY2B-204ENST00000615850 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 BPY2C-204ENST00000618574 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 LINC02389-201ENST00000535058 3546 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 ZNF704-201ENST00000327835 14386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 AL157756.1-201ENST00000532515 2859 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 SEC24D-211ENST00000511481 2626 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 STIL-204ENST00000396221 4558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 ZNF81-202ENST00000338637 7859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 AL136164.3-201ENST00000624429 3978 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 ADGRL2-209ENST00000370727 5164 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 DNHD1-201ENST00000254579 14862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 TCP11X1-202ENST00000622971 1372 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 SDHCP2-201ENST00000398565 501 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 SF3B1-202ENST00000409915 600 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 LINC00458-202ENST00000427299 1030 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 RPL21P91-201ENST00000429231 479 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 COX6B1P7-201ENST00000430845 235 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 AL121872.1-202ENST00000435867 308 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 AC099794.1-201ENST00000450811 447 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 RPS7P7-201ENST00000463499 571 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 AC107373.1-201ENST00000522570 603 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 IMMP1LP1-201ENST00000605170 488 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 COA1-220ENST00000640232 192 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 AL731532.2-201ENST00000623542 1953 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 CABS1-201ENST00000273936 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 AL022393.1-201ENST00000625142 1677 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 IKZF2-207ENST00000434687 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 THOC1-221ENST00000631280 2011 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 RPGRIP1L-212ENST00000621565 6038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 RALGAPB-202ENST00000397040 8435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 AC084357.3-201ENST00000541353 2751 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 ARPP19-208ENST00000566423 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 PDC-201ENST00000391997 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 SPRR2A-201ENST00000392653 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 CCL7-202ENST00000394627 696 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 ATP5F1P3-201ENST00000397213 657 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 RNA5SP36-201ENST00000410197 133 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CACNA1SQ13698 EBLN1-201ENST00000422359 1208 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
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