Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Length 790 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 MIR6780A-201ENST00000615089 68 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 BANCR-201ENST00000624238 473 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 AL731532.2-201ENST00000623542 1953 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 ABCA12-201ENST00000272895 9100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 UBE4A-202ENST00000431736 6061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 SCRG1-201ENST00000296506 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 UBR1-201ENST00000290650 7761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 STEAP2-205ENST00000394629 2261 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 KLHL13-201ENST00000262820 3972 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 SDC2-204ENST00000519914 1318 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 AL136164.3-201ENST00000624429 3978 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 UGP2-229ENST00000613823 1858 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 POU2F1-206ENST00000429375 13651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 ZC3H14-205ENST00000393514 2195 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 AC025574.1-201ENST00000554784 1653 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 SYNE2-203ENST00000357395 21555 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 AC010928.1-201ENST00000592477 1447 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 EYA1-203ENST00000388740 3788 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 FOXP1-IT1-201ENST00000498714 3539 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 R3HCC1L-201ENST00000298999 3379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 PDE4B-201ENST00000329654 3998 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 USP28-213ENST00000544967 3498 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 PSG11-201ENST00000306322 990 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 RPS4XP9-201ENST00000405151 780 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 NPM1P40-201ENST00000412758 733 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 RPL26P29-201ENST00000415623 438 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 AC119751.6-201ENST00000416712 186 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 MTCYBP7-201ENST00000419540 1134 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 BACH1-IT3-201ENST00000429843 406 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 AL050338.2-202ENST00000431609 956 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 AC007563.3-201ENST00000433233 371 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 AC105271.1-201ENST00000442876 497 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 AC026320.1-202ENST00000444729 672 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 CASP12-208ENST00000448103 1071 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 AL513533.1-201ENST00000453728 415 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 AP001439.1-201ENST00000455275 392 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 RN7SL738P-201ENST00000470264 297 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 NDUFB2-213ENST00000476470 482 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 CASP12-210ENST00000494737 961 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 AC073358.1-201ENST00000505671 684 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 AC083795.2-201ENST00000510034 610 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 RNU6-467P-201ENST00000517027 110 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 AC022915.1-201ENST00000521660 289 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
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CDH18Q13634 AL929601.2-201ENST00000549951 381 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 AL110118.1-201ENST00000553543 400 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 AL355076.2-201ENST00000555736 544 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 SNX6P1-201ENST00000601728 1224 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 AC005972.3-201ENST00000606304 481 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 AC092574.1-201ENST00000609771 420 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 Z95327.3-201ENST00000610385 572 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
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CDH18Q13634 AC084816.1-212ENST00000625240 1114 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 MPHOSPH9-211ENST00000541076 6136 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 TDRD3-204ENST00000377894 2484 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 PIGN-242ENST00000640145 4505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 DDX18P5-201ENST00000534547 1306 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 SMAD4-202ENST00000398417 8495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 ATP13A4-203ENST00000392443 4016 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 SPAM1-203ENST00000402183 1860 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 STAG2-204ENST00000371157 5991 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 RIF1-203ENST00000428287 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 DGKH-206ENST00000536612 3957 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 INPP4B-220ENST00000513000 8831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 ERGIC2-201ENST00000360150 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 MFSD4BP1-201ENST00000513330 1552 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
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CDH18Q13634 TRAV26-2-201ENST00000390460 327 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 SNORA79B-201ENST00000410557 148 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
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CDH18Q13634 AL359633.2-201ENST00000415787 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 RPA2P2-201ENST00000419698 796 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 AC245028.1-201ENST00000423259 256 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
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CDH18Q13634 FAR1P1-201ENST00000427163 934 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 AL606490.7-201ENST00000433136 191 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 LINC00446-202ENST00000438327 357 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 FMR1-IT1-201ENST00000441414 343 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 AL356421.2-201ENST00000446733 197 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 C2orf80-206ENST00000451346 979 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 RN7SL354P-201ENST00000469282 294 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 TOPORSLP1-202ENST00000469756 969 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 CMAHP-205ENST00000471416 1118 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 CREM-228ENST00000473940 1182 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 RPL23AP72-201ENST00000492447 435 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 PTPN20-213ENST00000502705 854 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 AC112206.2-204ENST00000504068 793 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 LINC02488-201ENST00000504287 652 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 AC108157.1-201ENST00000510511 539 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 RNU6-513P-201ENST00000516104 104 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 NRG1-IT1-201ENST00000520444 758 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 OR5M11-201ENST00000528616 1020 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 TAS2R46-201ENST00000533467 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 OR6C68-201ENST00000548615 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 AL133485.1-201ENST00000555966 392 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 AC093249.4-201ENST00000564755 259 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 AC005899.1-201ENST00000584125 563 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
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