Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 AC103853.1-201ENST00000520588 649 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 AC068768.1-204ENST00000544890 796 ntTSL 4 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 AC025260.1-201ENST00000548858 430 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 AC004825.1-201ENST00000555068 586 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 AC015660.2-201ENST00000561362 323 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 SULT1C2P2-201ENST00000562517 294 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 AC104938.1-202ENST00000563041 630 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 MIR4691-201ENST00000583764 85 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 AC005537.1-201ENST00000588324 1238 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 AC006116.3-201ENST00000592968 361 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 AC011374.2-201ENST00000607135 526 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 AC023813.4-201ENST00000607580 580 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 AL391834.2-201ENST00000609982 546 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 Z95327.3-201ENST00000610385 572 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 VN1R9P-201ENST00000614184 867 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 TEX41-254ENST00000626394 423 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 AC007389.5-201ENST00000629214 744 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 AC002384.2-201ENST00000636036 790 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 HSPA8P19-201ENST00000505359 1517 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 ANKRD36B-202ENST00000359901 4297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 ECM2-202ENST00000375540 1606 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 CASC19-261ENST00000641853 1638 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 PLEKHG7-201ENST00000344636 3868 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 BRCA1-203ENST00000357654 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 TTC39DP-201ENST00000416781 1688 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 MGP-203ENST00000539261 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 AC019197.1-201ENST00000638199 3611 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 OR4E1-202ENST00000641792 3742 ntAPPRIS P5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 MTO1-212ENST00000498286 10857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 IREB2-201ENST00000258886 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 METTL21EP-201ENST00000298105 713 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 SNORA62.2-201ENST00000364672 152 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 SNORA66-201ENST00000384792 133 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 FAIM-204ENST00000393035 946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 HMGB3P19-201ENST00000403971 560 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 RN7SKP229-201ENST00000410465 302 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 AL024507.1-201ENST00000412741 274 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 LINC01881-201ENST00000416103 412 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 AL451107.1-201ENST00000416310 408 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 AC097467.3-223ENST00000417474 449 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 BX510359.3-201ENST00000422168 306 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 LINC01798-203ENST00000428590 553 ntTSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 AC011242.1-201ENST00000433596 1158 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 LINC01704-202ENST00000442358 649 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 AC016903.1-201ENST00000444017 588 ntTSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 CASP3P1-201ENST00000446037 609 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 RPL31P44-201ENST00000447680 377 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 CASP12-207ENST00000447913 819 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 CASP12-208ENST00000448103 1071 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 AL157400.3-201ENST00000449882 1298 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 NDUFB2-213ENST00000476470 482 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 RPS18P6-201ENST00000476880 458 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 AC000372.1-201ENST00000488818 646 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 DWORF-201ENST00000489090 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 CAB39P1-201ENST00000502277 460 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 EGFLAM-AS3-201ENST00000505267 549 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 COX6B1P5-201ENST00000509843 249 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 AC021192.1-201ENST00000510169 791 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 RNA5SP34-201ENST00000516887 130 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 AC010476.1-201ENST00000519111 851 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 IGKV2D-10-201ENST00000520194 281 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 LINC02267-202ENST00000522173 799 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 AC104115.2-201ENST00000523026 687 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 LINC02448-201ENST00000548613 583 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 LINC02444-201ENST00000550723 1256 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 AL158801.3-201ENST00000555514 363 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 RN7SL753P-201ENST00000581238 290 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
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PTP4A2Q12974 AC044839.1-205ENST00000614989 542 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 CRNDE-213ENST00000635991 546 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 VCAM1-203ENST00000370115 2475 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 KCNRG-202ENST00000360473 1623 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 MYB-239ENST00000534121 2238 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 SCN2A-202ENST00000375427 8553 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 LINC01085-201ENST00000502759 1984 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 RABL3-201ENST00000273375 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 FAM197Y3-202ENST00000427622 2325 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 FAM197Y7-202ENST00000433321 2325 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 LINC01902-203ENST00000637369 7356 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 OTC-201ENST00000039007 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 ZNF273-204ENST00000476120 2000 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 DNAH5-201ENST00000265104 15633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 MARCH1-202ENST00000339875 2476 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 MUM1L1-202ENST00000357175 4173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 OR9K1P-202ENST00000641111 3217 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 IL1RAPL1-202ENST00000378993 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 DDX18P4-201ENST00000511690 1966 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 GABRG2-202ENST00000361925 3767 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 HNF4G-203ENST00000396423 4209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 AMELX-201ENST00000348912 737 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 SNORA73.1-201ENST00000363107 205 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 RNA5SP428-201ENST00000365129 132 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 OR14A2-201ENST00000366485 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 RNU6-468P-201ENST00000384003 109 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 CLEC7A-206ENST00000396484 1000 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 ATXN10-203ENST00000402380 564 ntTSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 BMS1P13-201ENST00000417301 885 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 DEFB130D-201ENST00000426866 237 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
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