Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 AC069157.1-201ENST00000421749 137 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 RN7SL810P-201ENST00000493031 276 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 AC108064.1-201ENST00000513791 460 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 AC103876.1-201ENST00000568634 418 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 AC129492.2-201ENST00000577807 517 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 AC090403.1-202ENST00000582108 833 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 AC011507.1-201ENST00000585364 567 ntTSL 4 BASIC4.48□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 AL157938.2-204ENST00000589667 826 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 AC100847.1-201ENST00000611316 481 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 BMPR1B-202ENST00000394931 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 SRGAP1-207ENST00000631006 8406 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 MTRNR2L13-201ENST00000604093 1445 ntAPPRIS P1 BASIC4.47□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 AC004803.1-201ENST00000503602 3207 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 GPR174-201ENST00000276077 1258 ntAPPRIS P1 BASIC4.47□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 MUCL1-201ENST00000308796 470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 AC097374.1-203ENST00000400783 485 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 ARHGAP26-IT1-201ENST00000433186 388 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 ACTR3P2-201ENST00000439585 1257 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 ANK3-207ENST00000460468 677 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 AC004704.1-201ENST00000511219 583 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 AC024958.1-203ENST00000520256 577 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 AC002091.1-201ENST00000578788 557 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 MIR3936-201ENST00000584304 110 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 AC020634.1-201ENST00000608701 549 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 AL356863.1-201ENST00000623378 1080 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 AC099654.3-201ENST00000447087 1546 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 FAM19A1-201ENST00000478136 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 NFIB-203ENST00000380934 2142 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 ELOVL7-203ENST00000505959 4165 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 KCNC4-201ENST00000369787 18750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 ZNF493-202ENST00000355504 4386 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 OR1A1-202ENST00000641322 3743 ntAPPRIS P1 BASIC4.47□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 LINC01689-201ENST00000416218 2007 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 RFC1-201ENST00000349703 4859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 AL133268.1-201ENST00000405676 1401 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 NFIB-211ENST00000606230 2311 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 AL158163.1-201ENST00000603915 1649 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 LINC01362-201ENST00000419658 338 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 RPL7AP25-201ENST00000423357 805 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 AC004938.1-201ENST00000438468 308 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 EIF4A2P4-201ENST00000458691 1196 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 AC090013.1-201ENST00000485147 480 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 SPTY2D1-AS1-203ENST00000542172 331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 AC009803.1-202ENST00000551940 544 ntTSL 4 BASIC4.47□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 LINC01709-202ENST00000635702 1204 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 PTPN3-203ENST00000412145 8765 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 AC005261.4-201ENST00000600047 1385 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 DSPP-201ENST00000282478 4281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 UGGT1-201ENST00000259253 10650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
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BPTFQ12830 TRIP12-204ENST00000389045 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 CHD2-208ENST00000626874 7764 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.69
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BPTFQ12830 AL132765.1-201ENST00000434165 553 ntBASIC4.46□□□□□ -1.69
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BPTFQ12830 AC139718.2-201ENST00000506068 481 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.69
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BPTFQ12830 RN7SL691P-201ENST00000494487 301 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
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BPTFQ12830 STAG1-201ENST00000236698 5951 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
BPTFQ12830 AC010186.3-201ENST00000537616 2508 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
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BPTFQ12830 EMSY-207ENST00000525919 4074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
BPTFQ12830 SLC10A2-201ENST00000245312 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
BPTFQ12830 PDE5A-203ENST00000394439 6770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
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BPTFQ12830 NCOA2-201ENST00000452400 8447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
BPTFQ12830 SPTLC3-201ENST00000399002 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
BPTFQ12830 RNA5SP509-201ENST00000364577 119 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
BPTFQ12830 PTMAP2-201ENST00000397627 327 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
BPTFQ12830 AC097467.3-223ENST00000417474 449 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
BPTFQ12830 AL121878.1-201ENST00000418638 859 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
BPTFQ12830 NFYAP1-201ENST00000431953 972 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
BPTFQ12830 RPL37P1-201ENST00000432310 284 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
BPTFQ12830 AL356276.2-201ENST00000435919 558 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
BPTFQ12830 AC025741.1-201ENST00000506100 544 ntTSL 4 BASIC4.46□□□□□ -1.7
BPTFQ12830 AF117829.1-202ENST00000524166 836 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
BPTFQ12830 PRH1-206ENST00000543626 710 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
BPTFQ12830 AC004542.2-201ENST00000602847 546 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
BPTFQ12830 AC020978.9-201ENST00000624380 1141 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
BPTFQ12830 LINC02341-201ENST00000637043 824 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
BPTFQ12830 FAM26D-202ENST00000368597 1311 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
BPTFQ12830 DOCK9-208ENST00000448493 7887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
BPTFQ12830 EXOC1-202ENST00000349598 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
BPTFQ12830 AGTR1-202ENST00000402260 2172 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
BPTFQ12830 AP001157.1-201ENST00000550837 2339 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
BPTFQ12830 RNA5SP119-201ENST00000362715 117 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
BPTFQ12830 RPS20P14-201ENST00000412545 360 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
BPTFQ12830 NPM1P26-201ENST00000426339 738 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
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